基因序列比对结果,这个样子怎么解释?

发布网友发布时间：2022-05-27 19:11

共4个回答

热心网友时间：2023-11-21 01:27

首先，你要把这个基因的起始位点标出来，就给这么点序列，不好给你分析。上面的DNA序列也不像从头开始的啊。下面的RNA序列也不知道是从什么地方开始的。这段基因到底是在基因的什么位置？
设计realtimePCR引物，一般选择mRNA的前边部分，另外，你这段序列的长度也不够，一共才119bp，扩增出来也不好区分，建议设计长度在150bp左右或者到200bp左右。可以明显降低实验的难度。引物二聚体的大学基本都差不多100bp大小了。为了实验方便，可以重新设计一下。
至于你对比的序列，有一个缺失或者是多出来一个，都是有可能的，建议你从新做一些反转录，看看再扩增出来测序结果怎么样。并且有这么一个缺少或者插入，只要不是引物中间的，对引物的敏感性就没有明显影响。不影响realtimePCR试验的结果。

热心网友时间：2023-11-21 01:28

转录并不只是搞出mRNA就完事，还要对mRNA进行加工，其中就包含切割成几段

热心网友时间：2023-11-21 01:28

可能不是同时转录，也可能是因为有终止子追问谢谢，那下面的基因序列能用来设计Realtime PCR的引物吗？

追答很困难。real time pcr的检测灵敏度比较高，所以相应的对引物设计的要求就很高Realtime PCR监测细胞mRNA表达量的变化；比较不同组织的mRNA表达差异；验证基因芯片……设计引物前出你知道的那些常规的，还要在提取前必须知道细胞数

热心网友时间：2023-11-21 01:29

应该是内含子，你BLAST一下就清楚了。