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hTFtarget:一个神奇的人类转录因子数据库

发布网友 发布时间:2024-10-14 06:38

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热心网友 时间:2024-12-03 17:11

hTFtarget:一个全面的人类转录因子与靶基因*数据库

人类转录因子(TFs)通过识别特定DNA序列来*基因表达,这对于理解生物学过程至关重要。hTFtarget作为一项重要的资源,整合了大量的人类转录因子靶基因数据,考虑了转录因子结合位点和基因组表观修饰状态,采用统一方法预测了高度可信的人类TF靶基因。这个开源数据库不仅提供了转录因子在不同细胞系和协作*的分析,还支持TF靶基因的查询研究,为转录因子*机制的研究提供了综合解决方案。


hTFtarget收录了699个转录因子的详细信息,包括2737个TFBS序列,并使用BETA模型量化*能力。它结合ROADMAP表观修饰状态,通过ChIP-Seq分析和TFBS扫描确保预测的准确性。该数据库由中国华中科技大学郭安源教授团队开发和维护,功能丰富,包括浏览TF靶基因、探索TF*、查询ChIP-Seq样本、分析TF协同*等,方便用户进行深入研究。



总结:
hTFtarget以详实的数据和强大的功能,为转录因子与基因*的研究者提供了有力的工具,便于挖掘转录*的深层机制,为生物学研究提供宝贵的信息支持。
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