DNA测序高通量测序技术
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发布时间:2024-10-19 08:37
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时间:2024-11-15 20:15
高通量测序技术,简称高通量测序或下一代测序技术,其特征在于能同时测定数十万至几百万条DNA分子,并且通常具有较短的测序读长。这一技术的发展历程中,涌现出了多种不同的测序方法,如大规模平行签名测序(MPSS)、聚合酶克隆(Polony Sequencing)、454焦磷酸测序、Illumina(Solexa)测序、ABI SOLiD测序以及离子半导体测序和DNA纳米球测序等。
MPSS,由Lynx Therapeutics公司早期开发,是新一代测序技术的先驱,基于磁珠和接头连接,主要用于转录组测序,研究基因表达。然而,由于其序列偏好性和可能导致特定DNA序列丢失的特性,以及操作复杂性,MPSS逐渐被淘汰,取而代之的是更为先进的技术。Lynx Therapeutics后来与Solexa合并,被Illumina收购。
Polony Sequencing是哈佛George Church实验室在2005年开发的,基于乳化PCR和自动显微镜,被整合到ABI公司的SOLiD测序技术平台中。454焦磷酸测序则是454公司研发的并行焦磷酸测序技术,通过在油溶液中进行DNA扩增和信号检测,每个水滴中只允许一个DNA模板分子进行扩增,形成独特的信号,从而读取DNA序列。
Illumina的Solexa测序采用可反转的染料终止法,DNA模板连接到固体介质上的引物上,通过逐个添加四种ddNTPs进行单碱基延伸,与454的焦磷酸测序相比,其读长和单碱基消耗处于两者之间。