单细胞测序好贵?细数测序究竟“贵”在哪里。

发布网友发布时间：2024-10-18 18:59

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热心网友时间：2024-11-05 23:10

单细胞测序技术在近年来受到广泛关注，其在揭示细胞异质性、进化、发育等方面展现出巨大潜力。然而，许多人对这一技术的成本持有疑虑，尤其是当得知一个样品的测序费用可能高达5万元时。那么，单细胞测序究竟“贵”在哪里呢？

首先，单细胞测序的高昂成本主要体现在设备和试剂上。一台10x Genomics Chromium Controller仪器的价格大约在80万元人民币，一套16反应的10X 3’v3转录组试剂包则需要30万元。此外，测序所需的费用与测序深度有关，如果一个样品捕获10000个细胞，按照每个细胞100K reads的饱和深度去测序，每个样品大约需要2万元测序费。从细胞到数据，每个样品大约花费4万元，这还不包括样品前期处理的精力和成本、建库必须的试剂耗材和人工技术服务等。

在分析阶段，单细胞测序的高成本还体现在对专业技能的要求。对于不熟悉R语言的生物医学研究人员来说，要么花费大量时间精力从头学习，要么需要额外支付高额费用以获得理想的结果分析。虽然在测序行业人士眼中，10X单细胞测序具有相当高的性价比，但对许多研究者来说，这一成本依然不容忽视。

尽管如此，单细胞测序技术的发展已经取得了显著进步。从1977年Sanger法的出现到如今，测序技术的发展大幅缩减了测序时间，降低了检测成本，形成了“超摩尔定律”之势。以基因组测序为例，从1990年启动的人类基因组计划耗时15年、预算高达30亿，到现在测一个人基因组只需两三天时间，费用为2000-3000元人民币，测序技术的发展可谓突飞猛进。

与普通测序相比，单细胞测序虽然在技术和成本门槛上更高，但随着技术的进步和新方法的涌现，单细胞测序变得更为简单和经济。从2013年Fluidigm公司推出世界上第一款单细胞RNA测序自动化准备系统后，许多新的建库方法层出不穷，单细胞测序的成本显著降低，已经走进了普通科研工作者的视线。

通过比较几种常用的单细胞测序方案，我们可以发现微流控技术的出现大大降低了单细胞测序的成本。使用微流控技术的Drop-seq、in-Drop等单细胞测序方案的建库成本在2-5元人民币/细胞之间，这比需要花费30元人民币/细胞的Smart-seq2（使用商业化的Smart-seq V4则需要700元人民币/细胞）更为经济。而相比于其他建库方案，商业化最为成功的10X Genomics Chromium方案在技术门槛较低、稳定性较高的同时，只需7元/细胞就能获得质量高、稳定可重复的数据，对有单细胞测序需求的研究者来说极具吸引力。

单细胞测序技术的真正价值在于其在科研领域的应用。尽管成本相对较高，但一篇高质量的文章往往需要对成千上万个细胞进行聚类分析，以全面可靠地揭示细胞异质性。一篇相关文章所需的单细胞测序预算大约在12万-20万左右，这体现了单细胞测序技术在科研中的重要价值。

综上所述，单细胞测序技术的成本主要体现在设备、试剂和分析阶段的高专业要求上。尽管成本相对较高，但随着技术的发展和应用的深入，单细胞测序已成为揭示细胞层次复杂性的有力工具，其在科研领域的应用价值不容忽视。