聊一聊 Image-Pro Plus 测量平均光密度。
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发布时间:2024-09-30 17:07
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时间:2024-09-30 22:39
在学术研究中,Image-Pro Plus (IPP) 是一款广泛使用的软件,它不仅能够进行图像增强、处理和分析,还能编写宏和插件。在生物医学研究领域,特别是在量化数字病理分析中,IPP 与专业病理分析软件 Tissue Studio 具有相似的作用。
平均光密度是IPP测量中的一个重要概念,它代表了视野内所有选定对象的平均反应强度。这使得平均光密度成为量化免疫组化(IHC)阳性表达强度的有效工具。然而,值得注意的是,只有在经过阳性表达的面积加权后,平均光密度才有实际意义。
在使用IPP测量平均光密度时,面积在计算过程中发挥着关键作用。在进行操作时,需要考虑这一因素。对于为何使用光密度而不是灰度值来反映IHC阳性强度,有人可能产生疑问。实际上,灰度值在Western Blot条带分析中更为适用,因为条带为白色荧光,背景为黑色。然而,IHC图像则不同,IHC图像以棕*代表阳性表达而背景为浅淡的*。因此,IHC图像的像素需要通过RGB三色表现。将IHC图像转换为黑白图后再计算灰度值的做法并不合适,因为这会忽略图片本身的颜色特征。
要使用IPP测量平均光密度,首先需要安装该软件。IPP软件在Windows XP、Win8和Win10系统上均可运行,但暂不支持Mac系统。安装方法包括运行start.exe文件来安装软件,然后将ipwin32.exe文件复制至安装目录并替换源文件。
在使用IPP测量平均光密度时,首先需要打开一张典型的免疫组化图片。图片中阳性表达和背景色对比强烈,最好是阳性表达为棕*而背景颜色接近白色的图片,以便进行光密度校正。然后,通过点击measure-calibration-intensity进行光密度校正。接下来,按照顺序点击按钮,将定标标准转换为光密度值。在设置黑水平和光源水平时,选择最深的颜色,以确保在测量其他图片时能够涵盖所有阳性物质。完成校正后,点击measure进行测量,设置测量指标为面积和平均光密度(IOD)。使用HIS模式进行颜色选择,确保所有阳性表达被选中。保存测量参数并进行数据分析。最后,计算平均光密度值为IOD Sum除以Area Sum,这是平均光密度的正确计算方式。
在进行IPP测量平均光密度的操作时,需要注意几个关键点:所有图片都必须进行光密度校正,HIS模式的测量参数应保持一致,可以通过文件加载功能进行调用或手动输入。通过阅读“Quantitative analysis of histopathological findings using image processing software”等文献,可以对IPP测量有更深入的理解和应用。
在学术研究中,使用IPP测量平均光密度不仅能够提高效率,还能提供精确的数据支持,对病理分析和细胞计数等研究具有重要意义。通过遵循上述步骤和注意事项,研究人员可以有效地利用IPP进行高质量的图像分析和数据处理。
聊一聊 Image-Pro Plus 测量平均光密度。
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