手把手教你绘制火山图与韦恩图

首先，访问Origin官方网站获取免费版软件，然后下载并安装Volcano plot APP。在软件中输入数据，X轴为基因名，Y轴为log10(P值)和log2(Fold Change)。设置阈值后，你可以得到清晰的火山图，如红色点表示上调的基因，绿色点则可能表示下调，但需注意具体数据的实际情况。对于火山图的美化，只需调整图例和...

今天呢，来简单演示下火山图的绘制方法，有数据的小伙伴可以试试！数据就以TNF组 vs 对照组；TGF组 vs 对照组；IL4组 vs 对照组三组差异基因来做案例。首先清除环境，安装并加载所需要的R包 读入数据并对数据做简单处理 读入IL4组差异数据 将3组数据构建成list 用venn包绘图 首先清除环境，安装并...

使用R语言绘制韦恩图。若不想编写代码，BioLadder生信云平台提供在线绘制功能，免费使用，只需登录。通过BioLadder平台，首先导入数据。上传文件或手动输入数据至输入框，上方输入分组名称，下方输入具体内容。调整参数以满足需求，提交数据后，图像会显示在左侧。若未上传数据，平台将使用默认demo数据进行绘图。...

柱状图则用于直观统计差异基因数量，反映组间基因表达差异的生物学意义。R语言和omicshare工具均可用于柱状图的绘制。韦恩图则展示不同组间的交集和并集，帮助理解基因的共性和独特性。使用Omicshare工具可以轻松制作静态或动态的韦恩图。火山图结合了p值和表达差异，用于展示显著变化的基因。ggplot2和omicshare提...

数据可视化：箱线图，南丁格尔玫瑰图，韦恩图，UpSet图，饼图，词云图，小提琴图，双向柱形图，弦图，柱形图等 组学数据分析：序列的多重比对，表达数据的CV曲线图，双向柱形图，T-SNE，热图，相关性热图等，趋势分析的mFuzz，差异分析的火山图，富集分析的气泡图，修饰位点上下游模体分析的seqLogo，...

韦恩图，这个精巧的可视化工具，通过对比不同组间的差异基因，清晰地展示出交集和并集的分布。origin、R包以及OmicShare等工具，为动态展示差异提供了多样化的选择。火山图，这个名字听起来就富有戏剧性，它将基因表达的显著性与变化幅度完美融合，是转录组研究中不可或缺的图形化表达方式。通过log2FC和FDR...

1. 数据可视化：箱线图、南丁格尔玫瑰图、韦恩图、UpSet图、饼图、词云图、小提琴图、双向柱形图、弦图、柱形图等。2. 组学数据分析：序列的多重比对、表达数据的CV曲线图、双向柱形图、T-SNE、热图、相关性热图等，趋势分析的mFuzz、差异分析的火山图、富集分析的气泡图、修饰位点上下游模体分析的...

使用韦恩图展示不同处理组之间的共性和差异，BioVenn1能有效展现不同组的元素数量以及相同点和不同点，同时展示数据集的大小。火山图用于表示组间差异表达蛋白的表达量变化，设置阈值为fold change < 1.5和p value < 0.05，标注TOP10差异表达蛋白。表达量高且显著性高的差异蛋白通常被选为目标蛋白，...

往期回顾 R绘图 | Cell-Type Enrichment分析探索 R绘图|韦恩图的常见绘制方法 R绘图|ggplot2火山图的绘制 R绘图|ggplot2散点图的绘制 R绘图|pheatmap热图绘制——基础篇 R绘图|pheatmap热图绘制——中阶篇 R绘图|pheatmap热图绘制——高阶篇 ...

此外，【鼠小弟】不仅限于绘制散点图，还提供多种图表绘制功能，包括折线图、条形图、碱基分布图、韦恩图、聚类图、热图、火山图、主成分分析(PCA)图及分类柱状图等，以满足科研人员在不同数据分析场景中的需求。同时，平台还提供序列处理相关工具，如FASTQ质控与序列名称简化，进一步扩展了其应用范围。