Nature | 康奈尔医学院实现单细胞体细胞突变和表观遗传改变联合分析

发布网友发布时间：2024-09-27 03:26

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热心网友时间：2024-10-03 07:59

康奈尔医学院的研究团队在《Nature》杂志上发表了一项突破性成果，他们开发了一种名为GoT-ChA的单细胞分析平台，旨在同时分析体细胞突变和表观遗传改变，以揭示这些改变如何影响克隆群体的生长和分化。GoT-ChA通过高通量技术，将基因型信息与单细胞染色质可及性紧密关联，从而揭示了突变如何以细胞内和类型特异的方式影响表观遗传重组，塑造分化轨迹。

研究者使用GoT-ChA对混合了不同TP53R248基因型的人类细胞系进行分析，结果显示了高精度的基因分型。此外，他们通过混合不同JAK2V617F状态的细胞，证明了GoT-ChA在杂合子基因分型检测中的准确性，即使在高GC含量靶点下也能实现有效基因分型。在对JAK2V617F突变的血液系统疾病样本中，GoT-ChA揭示了早期表观遗传变化，以及突变细胞在分化过程中的不均匀分布，揭示了炎症表观遗传启动的特性。

研究还发现，JAK2V617F突变对造血干细胞的表观遗传学有显著影响，导致促炎和髓系倾向的启动，同时与红细胞分化过程中的持续效应有关。GoT-ChA与ATAC-seq整合的ASAP-seq技术进一步拓展了多模态单细胞分析，允许同时检测染色质可及性、细胞表面蛋白表达和基因表达，为深入理解突变体细胞的动态变化提供了新视角。

总的来说，这项研究展示了GoT-ChA在体细胞突变和表观遗传研究中的强大潜力，为理解恶性与非恶性环境中的关键联系奠定了基础，预示着未来在癌症和其它疾病研究中的广泛应用。两位教授，Dan A. Landau和Ross L. Levine，分别在肿瘤进化和血液恶性肿瘤研究领域做出了重要贡献，期待GoT-ChA技术能推动更多科研突破。