基于DNA损伤反应基因的神经网络模型预测低级别胶质瘤患者预后
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发布时间:2024-09-25 14:25
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时间:2024-11-30 01:36
基于DNA损伤反应基因的神经网络模型在预测低级别胶质瘤(LGG)患者预后方面展现了前景。本文详细介绍了2021年发表的研究,该研究构建了一种ANN模型,通过分析DDR基因在LGG患者中的表达谱来评估预后。DDR的异常通路不仅影响肿瘤发展,还与治疗耐药相关,因此,这些基因成为预测患者生存的关键因素。
研究者从TCGA和CGGA数据库中收集了493例训练样本和408例验证样本,重点关注了8个DDR途径中的185个基因。分析显示,LGG组织中大部分DDR基因异常表达,其中79个上调,93个下调。通过单因素Cox回归和聚类分析,发现了118个预后相关基因,这些基因在预后亚型中表现出不同的激活模式,subtype2患者的预后最差。构建的神经网络模型由三层组成,输入为DDR基因表达,输出是预后评分(PI)。PI模型表现出较高的C-index和AUC,优于传统的突变预后模型。
在预后模型的评估中,作者通过亚组分析证实了模型的稳健性,无论突变状态如何,高PI值都对应较差的生存。此外,nomogram进一步证实了模型在预测不同时间点生存概率方面的准确性。研究还揭示了高PI患者与免疫微环境的复杂关系,包括免疫细胞丰度、抗原处理和免疫抑制机制的改变,这可能解释了预后差异的生物学基础。
总的来说,这项研究通过DDR基因表达的神经网络模型,为LGG患者的预后评估提供了新的视角,为个体化治疗策略的制定提供了依据。"