...| 探索遗传信息“噪音基因”-LncRNA的生物学调控

发布网友 发布时间：2024-09-26 09:57

我来回答

共1个回答

热心网友 时间：2024-10-05 08:26

长链非编码RNA（LncRNA）是基因长度大于200nt的统称，最初被认为是基因组转录中的“噪音”片段。然而，近年来研究发现，LncRNA在真核生物生命活动中扮演着重要角色，参与了多种调控过程，包括表观遗传调控、转录调控、ceRNA调控等，成为研究热点。

LncRNA根据其基因组位置可分为正向、反向、内含子、基因间和双向LncRNA，这些分类有助于理解LncRNA在基因调控中的作用模式。LncRNA在DNA、RNA和蛋白间的调控功能主要依靠其二级结构，以及与蛋白质的结合，可以引发染色质重构、转录功能调控等。LncRNA还能通过ceRNA机制，与miRNA竞争性结合，影响下游靶基因的表达量。此外，一些LncRNA能够编码小肽，参与细胞生命活动。

LncRNA研究常用数据库可以查询到基因信息、亚细胞定位、SNP位点、编码能力及相关疾病等信息。LncRNA研究方案包括LncRNA靶点筛选、功能研究和机制研究，通过生物信息学分析、RNA-seq和芯片技术等方法筛选差异性表达的LncRNA，并通过过表达、敲低、敲除等调控方式研究LncRNA的功能和作用机制。此外，LncRNA与DNA、RNA的互作以及与蛋白的互作对于理解其功能至关重要。

了解LncRNA的调控作用和研究方法对于深入探索基因组复杂性表达调控的难题具有重要意义。研究LncRNA不仅可以揭示疾病机制，还可以为开发新型治疗策略提供理论依据。未来，随着技术的发展，对LncRNA功能和调控机制的研究将更加深入，为生物医学研究和临床应用带来新的突破。

参考文献：
[1] Lee JT. Epigenetic regulation by long noncoding RNAs. Science (New York, NY). 2012; 338(6113): 1435-1439.
[2] Hermans-Beijnsberger S, van Bilsen M, Schroen B. Long non-coding RNAs in the failing heart and vasculature. Noncoding RNA Res. 2018 Apr 14; 3(3): 118-130.
[3] Robinson EK, Covarrubias S, Carpenter S. The how and why of lncRNA function: An innate immune perspective. Biochim Biophys Acta Gene Regul Mech. 2020 Apr; 1863(4): 194419.
[4] Ingolia NT, Lareau LF, Weissman JS. Ribosome profiling of mouse embryonic stem cells reveals the complexity and dynamics of mammalian proteomes. Cell. 2011 Nov 11; 147(4): 789-802.
[5] Chen J, Brunner AD, Cogan JZ, et al. Pervasive functional translation of noncanonical human open reading frames. Science. 2020; 367(6482): 1140-1146.
[6] Lennox KA, Behlke MA. Cellular localization of long non-coding RNAs affects silencing by RNAi more than by antisense oligonucleotides. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 29; 44(2): 863-77.
[7] Han J, Zhang J, Chen L, Shen B, Zhou J, Hu B, Du Y, Tate PH, Huang X, Zhang W. Efficient in vivo deletion of a large imprinted lncRNA by CRISPR/Cas9. RNA Biol. 2014; 11(7): 829-35.
[8] Li X, Fu XD. Chromatin-associated RNAs as facilitators of functional genomic interactions. Nat Rev Genet. 2019 Sep; 20(9): 503-519.

热心网友 时间：2024-10-05 08:28

长链非编码RNA（LncRNA）是基因长度大于200nt的统称，最初被认为是基因组转录中的“噪音”片段。然而，近年来研究发现，LncRNA在真核生物生命活动中扮演着重要角色，参与了多种调控过程，包括表观遗传调控、转录调控、ceRNA调控等，成为研究热点。

LncRNA根据其基因组位置可分为正向、反向、内含子、基因间和双向LncRNA，这些分类有助于理解LncRNA在基因调控中的作用模式。LncRNA在DNA、RNA和蛋白间的调控功能主要依靠其二级结构，以及与蛋白质的结合，可以引发染色质重构、转录功能调控等。LncRNA还能通过ceRNA机制，与miRNA竞争性结合，影响下游靶基因的表达量。此外，一些LncRNA能够编码小肽，参与细胞生命活动。

LncRNA研究常用数据库可以查询到基因信息、亚细胞定位、SNP位点、编码能力及相关疾病等信息。LncRNA研究方案包括LncRNA靶点筛选、功能研究和机制研究，通过生物信息学分析、RNA-seq和芯片技术等方法筛选差异性表达的LncRNA，并通过过表达、敲低、敲除等调控方式研究LncRNA的功能和作用机制。此外，LncRNA与DNA、RNA的互作以及与蛋白的互作对于理解其功能至关重要。

了解LncRNA的调控作用和研究方法对于深入探索基因组复杂性表达调控的难题具有重要意义。研究LncRNA不仅可以揭示疾病机制，还可以为开发新型治疗策略提供理论依据。未来，随着技术的发展，对LncRNA功能和调控机制的研究将更加深入，为生物医学研究和临床应用带来新的突破。

参考文献：
[1] Lee JT. Epigenetic regulation by long noncoding RNAs. Science (New York, NY). 2012; 338(6113): 1435-1439.
[2] Hermans-Beijnsberger S, van Bilsen M, Schroen B. Long non-coding RNAs in the failing heart and vasculature. Noncoding RNA Res. 2018 Apr 14; 3(3): 118-130.
[3] Robinson EK, Covarrubias S, Carpenter S. The how and why of lncRNA function: An innate immune perspective. Biochim Biophys Acta Gene Regul Mech. 2020 Apr; 1863(4): 194419.
[4] Ingolia NT, Lareau LF, Weissman JS. Ribosome profiling of mouse embryonic stem cells reveals the complexity and dynamics of mammalian proteomes. Cell. 2011 Nov 11; 147(4): 789-802.
[5] Chen J, Brunner AD, Cogan JZ, et al. Pervasive functional translation of noncanonical human open reading frames. Science. 2020; 367(6482): 1140-1146.
[6] Lennox KA, Behlke MA. Cellular localization of long non-coding RNAs affects silencing by RNAi more than by antisense oligonucleotides. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 29; 44(2): 863-77.
[7] Han J, Zhang J, Chen L, Shen B, Zhou J, Hu B, Du Y, Tate PH, Huang X, Zhang W. Efficient in vivo deletion of a large imprinted lncRNA by CRISPR/Cas9. RNA Biol. 2014; 11(7): 829-35.
[8] Li X, Fu XD. Chromatin-associated RNAs as facilitators of functional genomic interactions. Nat Rev Genet. 2019 Sep; 20(9): 503-519.