发布网友 发布时间:2024-09-30 05:46
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热心网友 时间:2024-10-27 07:51
蛋白质组学研究中,双向凝胶电泳技术(2-DE)和质谱技术是两种广泛应用的方法。2-DE通过蛋白质的等电点和分子量差异进行区分,尽管存在低丰度蛋白识别困难和操作复杂性,但因其高通量、高分辨率和重复性好,以及可与质谱联用的特点,使其成为研究蛋白质组的首选手段。研究流程包括样品制备、等电聚焦、聚丙烯酰胺凝胶电泳、染色、蛋白点挖掘、酶切、质谱分析等步骤,以确定肽指纹图谱和氨基酸序列,最终通过数据库确定蛋白身份。
Unlu等人提出的荧光差异显示双向电泳(F-2D-DIGE)方法改进了定量蛋白质组学分析,结合多重荧光标记,提高了结果的准确性和重复性。在DIGE技术中,每个蛋白点都有内标,软件自动校准表达量,确保结果的真实可信。HPLC技术,尽管常用于全蛋白组分析,但其对动态范围大、低丰度和疏水蛋白的分析有限。Chong等人利用HPLC/质谱对比分析肿瘤样本,实现了动态蛋白质表达的定量分析。
表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF)技术因其简便、无需预处理和对复杂样本分析的优势,成为理想的研究平台。它能直接检测多种生物样本中的蛋白质特性,如分子量、PI和糖基化位点。同位素标记亲和标签(ICAT)技术则通过标记和质谱分析,实现快速、准确的蛋白质表达比较,尤其适合疏水蛋白的检测。
在现代蛋白质组学研究中,生物信息学扮演着关键角色,它能处理和分析蛋白质组数据,对基因组和蛋白质组进行全面分析,提供深度洞察。数据库储存了各种蛋白质信息,使得通过简单的点击操作,研究人员就能获取蛋白质信息。
蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组(genOME),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(PROTein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变. 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是一个基因组的直接产物,蛋白质组中蛋白质的数目有时可以超过基因组的数目. 蛋白质组学(Proteomics)处于早期“发育”状态,这个领域的专家否认它是单纯的方法学,就像基因组学一样,不是一个封闭的、概念化的稳定的知识体系,而是一个领域.