GO分析和KEGG分析都是啥?

发布网友发布时间：2024-09-04 19:01

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热心网友时间：2024-09-04 20:21

在进行差异表达分析的常见流程中，GO分析和KEGG分析是不可或缺的环节。它们分别是什么，又为何进行富集分析？

首先，富集分析的目的是从海量的基因差异表达结果中，通过宏观视角理解基因功能的共同模式，避免孤立基因带来的混乱。它就像是从微观层面的细节到宏观层面的概括，帮助我们形成对整体事件的深入理解。例如，通过富集分析，我们可以得出“TP53信号通路与胃癌的发生有关”这样的结论，而非列举多个具体基因。

其次，GO（Gene Ontology）和KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）是两种基因功能数据库。GO侧重于基因的基本功能，如蛋白质结构域和文献研究，提供基因功能的分类信息。而KEGG则更深入，不仅包含基因功能，还涵盖了基因参与的人体生物通路，如SRSF1的例子所示。

最后，富集分析作为连接GO和KEGG的关键步骤，是对这两种数据库中基因功能信息的整合和计算，最终得出一个综合性的、宏观的解读结果。尽管有多种富集分析算法，但它们的核心目标是将数据库中的个体信息转化为整体趋势的洞察。