SSCP详细内容
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发布时间:2024-08-07 08:45
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时间:2024-08-18 02:48
单链DNA分子通常展现出复杂的三维折叠结构,这个结构主要由碱基配对等分子内相互作用力维持。任何碱基的变动都会对这种结构产生影响,导致构象变化。这种构象差异在单链DNA分子在聚丙烯酰胺凝胶中的排阻大小上有所体现,因此,通过非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)技术,能够精确地分离出构象不同的分子。这种方法被称为单链构象多态性(SSCP)分析。
在PCR-SSCP技术中,突变检测的简便性和灵敏性得到了提升。其基本步骤包括:首先,通过PCR扩增目标DNA;其次,对特定的PCR产物进行变性,然后迅速复性,使其形成具有空间结构的单链DNA;接着,将适量的单链DNA进行非变性凝胶电泳;最后,通过放射性自显影、银染或溴化乙锭进行结果分析。如果观察到单链DNA的迁移速度与正常对照有差异,那么可以推断其构象发生了变化,暗示DNA片段可能存在碱基突变。
尽管SSCP方法简便、快速且灵敏,无需特殊设备,适用于临床实验,但它也存在局限性。首先,它主要用于突变检测,想要确定突变的确切位置和类型,还需进一步进行测序。其次,电泳条件的控制非常重要。此外,由于SSCP依赖于点突变对单链DNA构象的影响进行分离,某些位置的点突变可能对构象影响不大,加上其他因素,可能导致某些突变无法在聚丙烯酰胺凝胶电泳中被准确检测到,从而造成漏检的风险。