反义RNA人工合成构建反义RNA
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发布时间:2024-08-07 05:17
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时间:2024-08-17 23:42
在原核生物中,反义RNA的调控作用显著,人工合成非天然的反义RNA以调控特定基因的表达已经成为可能,并在多项实验中得到了验证。然而,由于对靶mRNA的SD序列上游区域结构知之甚少,设计出能与之结合的Ⅱ类反义RNA,以影响mRNA翻译,仍是一项挑战。
Ⅲ类反义RNA通过与mRNA的起始部位结合,形成ρ-不依赖性转录终止子,从而在转录层面抑制靶基因的表达。为了实现这一目标,需要在靶mRNA中寻找连续的U序列,设计出与之互补的反义RNA,确保它能形成ρ-不依赖性终止子,且理想位置应在5'端上游的非编码区域,以避免核糖体的干扰。
对于Ⅰ类反义RNA,一旦靶基因的核苷酸序列明确,就可以进行人工设计。有时候,设计出同时具有Ⅰ类和Ⅲ类功能的反义RNA,能提供更全面的调控效果。此外,反义RNA的反义设计,即设计出拮抗原反义RNA的反义RNA,可以抵消其对靶mRNA的抑制作用,从而增强或激活特定基因的表达。
值得注意的是,并非所有mRNA对相应的Ⅰ类反义RNA都敏感。一些寿命较短的mRNA,结合反义RNA的机会少,因此对抑制作用不太敏感。相反,稳定性高的mRNA则对反义RNA的抑制作用更敏感。反义RNA的稳定性在实际应用中至关重要,稳定性的反义RNA能更有效地调节靶mRNA的表达。
扩展资料
反义RNA,根据反义RNA的作用机制可将其分为3类:Ⅰ类反义RNA直接作用于靶mRNA的S D序列和(或)部分编码区,直接抑制翻译,或与靶mRNA结合形成双链RNA,从而易被RNA酶Ⅲ 降解;Ⅱ类反义RNA与mRNA的非编码区结合,引起mRNA构象变化,抑制翻译;Ⅲ类反义RNA则直接抑制靶mRNA的转录。
反义RNA人工合成构建反义RNA
在原核生物中,反义RNA的调控作用显著,人工合成非天然的反义RNA以调控特定基因的表达已经成为可能,并在多项实验中得到了验证。然而,由于对靶mRNA的SD序列上游区域结构知之甚少,设计出能与之结合的Ⅱ类反义RNA,以影响mRNA翻译,仍是一项挑战。Ⅲ类反义RNA通过与mRNA的起始部位结合,形成ρ-不依赖性...
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