成功案例——转录组+代谢组联合分析揭示了紫茶花中苯类-苯丙烷色素和香...
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发布时间:2024-09-15 08:13
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时间:2024-09-23 21:27
代谢物与表型最为接近!一方面,代谢物能反映生物体的真实生理状态,代谢物的变化直接导致表型的变化。相比于其他组学,代谢组受环境影响最大,环境对生物体的影响也是最终体现为代谢物的变化。但是单独代谢组检测,无法解释影响表型的基因机理,相反,转录组的表达不能直接证明表型是否发生变化。为了结合转录和代谢的优势,我们可以进行转录组+代谢组的联合分析,同时实现从“因”和“果”两个层面来探究生物学问题,相互间进行验证,从海量的数据中筛选出关键基因、代谢物及代谢通路,深度解析生物系统的宏观发育过程,解释生物过程的复杂性和整体性。
代谢物是植物表型(功能)的物质基础,园艺植物包括水果、蔬菜、花卉等,具有丰富的颜色性状和品质性状,这些性状和功能的物质基础是研究的热点方向。华南农业大学园艺学院张凌云老师团队近期在《Frontiers in plant science》上发表关于代谢组和转录组的联合分析,揭示了茶树BP型色泽与香气的关系,确定了花青素运输相关途径中的基因表达谱。
苯类化合物,尤其是苯丙烷,是植物颜色和香气的主要来源,它们帮助植物吸引传粉动物或阻止外敌侵害。类苯和类苯丙烷(BPs),例如类黄酮,是一组次级代谢产物,来源于莽草酸途径中的两种芳香族氨基酸苯丙氨酸(Phe)和酪氨酸。
茶叶之所以成为一种受欢迎的非酒精饮料,其多样性和丰富的香气是两个原因。茶叶中的主要挥发性BPs为2-PE、Balc和MeSA,而AP和1-PE在茶花中是独特的。挥发性BPs和非挥发性BPs有一个共同的上游合成途径。它们都来源于苯丙氨酸,苯丙氨酸是由莽草酸途径产生的,苯丙氨酸分别进入苯丙氨酸代谢和合成途径。前者继续形成挥发性BPs,后者形成类黄酮,包括花青素。研究BP色素和香气的理想材料最好是含有尽可能多的花青素和挥发性BP。紫娟是一个特殊的茶树品种,有紫色的芽、茎和叶,但仍然缺乏AP和1-PE。此外,和其他茶叶品种一样,紫娟的花也是白色的,这意味着花青素的含量较低。然而在中国广东省白塘镇的茶园里找到了一份完美的材料,一种自然突变的品种(BT;C.sinensisvar.Baitang)有紫色的叶子和花。这个品种为研究BPs在茶树中的代谢以及BPs引起的色香味关系提供了更好的模型。
作者将茶花重新划分为三个阶段,即成熟花蕾(阶段1)、开花前(阶段2)和开花(阶段3)。此外,花香一般会在开花后大量释放,考虑到早期花青素的形成和香气的量,该研究选择了阶段2作为实验对象。
在这项研究中,为了研究挥发性和非挥发性BPs对紫色茶花的气味和颜色的作用,在白色(ZJ品种)和紫色(BT品种)茶花瓣中测定了BP型香气和花青素(图1),确定了生物合成和花青素运输相关途径中的基因表达谱,并分析了调节ZJ和BT之间气味和颜色变化可能的TFs。
实验材料与方法:在广东省白塘镇的茶园中培育了紫茶花BT和白花茶花ZJ。采摘第2阶段(开花前)的花朵,收集花瓣液氮速冻,-80℃保存。实验方法:百迈客转录组测序平台:Illumina HiSeq 2500,紫茶花BT和白花茶花ZJ各3各生物学重复。代谢组:GC-MS
主要结果与分析:挥发性苯类-苯丙烷类及相关基因分析。在白色和紫色茶花中,最丰富的挥发性苯化合物(BPs)是MeSA和AP、1-PE。在白色茶花中,MeSA是主要的挥发性BPs,相对于白色茶花,紫色茶花中的AP高出2倍。除MeSA外,其他常见挥发性BPs在紫色花朵中显著升高:1-PE、Bald和Balc分别为高出2,2.9,2.8倍;而在白花中没有检测到2-PE。总体上,紫茶花中的BPs发生了变化,其中苯丙烷类(AP、1-PE和2-PE)高于其他苯类(Bald、Balc和MeSA),而在正常的白色花朵中,则相反,这表明紫色茶花中苯丙烷类化合物的合成途径被促进。
非挥发性苯类-苯丙烷类及相关基因分析。在这两个品种的花瓣中共检测到20种花青素,其中5种花青素为苷元,分别为Pg、Cy、Dp、Pn和Pt。两种花色茶花中都有两到三种花色苷未检测到,即:白色茶花中的petunidin-3-O-(6’’-O-p-coumaroyl)glucoside-5-O-rhamnoside,cyanidin-3-O-(6’’-O-caffeoyl-2’’-O-xylosyl)glucosid和pelargonidin-3-O-glucoside ,以及紫色茶花中的cyanidin-3-O-(6’’-O-p-coumaroyl)rutinoside-5-O-glucoside 和cyanidin-3-O-caffeoylsophoroside(图3A)。这20种花青素的总含量紫色花瓣比白色花瓣高1.9倍。根据苷元类型,20种花色苷可分为2个Pg、11个Cy、1个Dp、2个Pn和4个Pt,其中Cy和Dp是主要的苷元(图3B)。
参与苯类-苯丙烷生物合成的转录因子。上述结果表明,在紫色花朵中,最具特征的挥发性和非挥发性BPs分别为AP和DpG。计算了Ps和TFs之间的皮尔逊相关系数,发现这两个茶叶品种之间存在显著差异。AP和DpG的14个TF的相关系数大于0.95(表1)。他们属于AP2/ERF、bZIP、EMP、GATA、HS、MYB、NAC、TCP和WRKY家族,在紫色花种分别高出1.6–6.7倍,其中MYB、AP2/ERF、bZIP、TCP和GATA的表达水平最高。
总结:研究发现在BT紫色花瓣中,BP型香气随着BP型颜色的出现而增加。AP和DpG大量累积,是主要的挥发性和非挥发性BPs,此外莽草酸途径中的结构基因和挥发性BPs的合成得到了促进。类黄酮合成途径的大多数基因被下调,并且流出被引导积累Dp。许多TF参与调节紫色及其相关香气。该研究结果揭示了茶树BP型色泽与香气的关系,为了进一步阐明调控机制,未来需要对相关基因的功能进行更多的鉴定。