一个共价闭合环形DNA 分子中含2100bp, 每个DNA 螺旋由10.5bp 组成,这 ...

发布网友发布时间：2024-08-20 02:55

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热心网友时间：2024-08-26 06:15

lingking number（Lk）定义为完全分开两条缠绕的cccDNA单链时，一条链必须穿过另一条链的次数。对于特定的cccDNA，这个数值不因DNA的超螺旋或其它扭曲而改变。

当cccDNA完全释放为正常B型双链DNA时，其Lk值定义为Lk0，它在数值上等于DNA碱基对总数目/每个螺旋的碱基对数目（10.5）.本题中Lk0=2100/10.5=200。

实际的cccDNA中Lk并不总等于Lk0，这种差异定义为Linking difference (ΔLk)。ΔLk=Lk-Lk0.当ΔLk小于0时DNA是负超螺旋（扭矩程度变小），当ΔLk大于0时是正超螺旋（扭得更紧）。
超螺旋密度用于说明这种程度，定义为σ=ΔLk/Lk0

本题中0.05=ΔLk/200 推得ΔLk=10，进而推得Lk=200+10=210.

Tw (Twist)指的是一条链完全穿过另一条链的次数。当不存在超螺旋，即cccDNA平展开时，这个值就是Lk。

Wr (Writhe)是指超螺旋结构中一条DNA双链缠绕另一条DNA双链的次数。这种超螺旋可以释放部分环状双螺旋的张力。对于特定的cccDNA，在不打开共价键断开DNA链的条件下，Lk=Tw+Wr.

因为你题目中没有说明该分子有没有supercoiling,所以不能确定具体的Tw和Wr。如果认为没有超螺旋，则Tw=210,Wr=0

热心网友时间：2024-08-26 06:18

什么专业的