热图看不懂、做不来?学完这篇就会了

发布网友发布时间：2024-08-18 23:45

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热心网友时间：2024-08-22 20:27

掌握热图并非难事，它作为生信入门必备技术，主要用于基因或RNA表达的可视化。然而，初次接触可能会被复杂的色块和分析方法困扰。首先，热图本质上是数值矩阵的色彩化呈现，每个小色块代表一个数值，通过预设的色键映射颜色。面对不同样本和基因表达量的跨度大，通常通过对数或Z-score处理，让色键范围保持在可识别的范围内。

热图中，横条色块用于标记实验分组，如组织类型或样本来源，树形图则展示了聚类分析的结果，枝条的长度指示了样本间的相似程度。如果数据量庞大，如高通量测序结果，可能需要进行预处理和聚类，如R语言或在线工具如ClustVis、Morpheus来简化图形。在Morpheus等工具中，用户只需上传数据，选择合适的格式，设置排版和分析参数，就能得到清晰的热图。

最后，导出时会附带色键，而且保存的json文件方便后续修改。通过这些步骤，即使是对热图一无所知的人，也能逐渐掌握这个基本的可视化工具。想深入了解热图制作，可以关注“解螺旋”微信公众号获取详细教程和资源。