聊聊使用MEGA软件的方法和步骤,构建不同类型的序列进化树!

发布网友发布时间：2024-09-07 00:15

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热心网友时间：2024-09-29 12:37

系统进化树是一种直观展示物种DNA或蛋白质分子进化关系的工具，常在文献中见到。构建进化树的常用软件是MEGA。

以下是使用MEGA软件构建进化树的方法和步骤：

1. 首先下载并安装MEGA软件，网址为：megasoftware.net/。

2. 将需要构建进化树的序列整理成FASTA格式文件，导入MEGA软件。

3. 在软件中，选择Align下的Edit/Build Alignment键，进行序列比对。

4. 使用Edit/delete功能调整比对结果，使其长度一致。

5. 将比对结果保存为MEGA格式文件。

6. 在主界面打开保存的文件，选择PHYLOGENY，根据实际需要选择系统进化树的构建方法，如Neighbor-Joining或Maximum Likelihood。

7. 一般情况下，无需修改参数，构建结果如下。

8. 可以尝试不同的进化树形式，如环形、斜线、弧线等。

9. 这些不同类型的进化树可以根据自己的需求进行尝试。