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解读| 变异丰度和拷贝数是什么?

发布网友 发布时间:2024-09-07 00:26

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热心网友 时间:2024-09-17 16:50

基因检测中的变异丰度和拷贝数详解


在基因检测报告中,变异丰度(VAF)和拷贝数(CN)这两个数值对解读至关重要,它们揭示了肿瘤的特性,有助于个性化治疗。理解这些数值对于临床决策至关重要,但往往被忽视。本文将深入解析这两个概念及其在临床应用中的作用。


变异丰度

变异丰度表示肿瘤细胞中突变DNA占总DNA的比例,是突变DNA与野生型DNA的比率。它适用于多种类型的突变,如点突变、插入/缺失等。计算时要考虑肿瘤细胞占比、等位基因的杂合性,还需考虑其他干扰因素。例如,当检测到两种突变,高丰度突变可作为估算细胞占比的线索。


拷贝数变异

拷贝数变异涉及基因在特定区域的拷贝数增加或减少。通常以拷贝数或扩增倍数表示,反映肿瘤细胞中基因的平均数量。计算拷贝数时,需结合肿瘤占比和校正CNV值。拷贝数变异在预后评估和疗效预测中也起着重要作用。


应用在预后和疗效预测

基因丰度可用于预后评估,如血液VAF高可能预示较差的治疗反应。动态监测VAF变化有助于判断治疗效果,如VAF下降通常表示疗效好。同时,VAF还用于指导治疗策略,如BRAF V600突变的血液VAF与靶向治疗反应相关。


总的来说,理解并正确解读基因检测报告中的变异丰度和拷贝数,对肿瘤患者个体化治疗决策至关重要。临床医师需结合患者具体情况,利用这些数据制定最佳治疗方案。

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