Dmol3:在Linux下安装及其跨平台作业示例
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发布时间:2024-10-04 17:34
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时间:2024-10-04 22:18
Dmol3,作为MS中出色的量子力学计算程序之一,现今在Linux系统下的应用日益广泛。本文将展示如何在Linux环境下安装Dmol3,并进行跨平台的作业示例。
首先,让我们开始Dmol3在Linux的安装过程。为了支持32位库,需要安装以下组件:sudo dpkg --add-architecture i386,然后通过apt-get install安装所需库。解压MS安装包后,修改license文件,接着运行./install,按照提示完成许可证配置。最后,将修改后的license文件拷贝到指定目录,直到安装过程结束并选择99退出。
安装完成后,配置Dmol3环境变量至关重要。将这些变量添加到~/.bashrc或创建一个shell文本文件,运行时source即可。运行Dmol3命令的示例如下:RunDMol3.sh -np 8 filename >out.log &,其中np代表CPU核心数,可以根据需求调整。
跨平台作业示例中,从Windows的MS中设置好计算参数,如赝势、基组等,保存文件后,将计算文件夹拷贝到Linux,如C6H14O6。在Linux上,对于26个原子的电荷密度计算,只需几秒钟,家用电脑也能轻松胜任。计算完毕后,将结果文件夹复制回Windows的MS文档目录,进行后续的数据分析和处理。
继续进行CuS的TDOS和元素LDOS计算,结果可以转换成常见的格式,如xsf和dat,以便用VESTA、VMD或Origin等软件进行数据可视化。