PolyMaker安装及使用
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发布时间:2024-10-02 11:13
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热心网友
时间:2024-10-21 06:14
在材料科学领域,多晶是金属材料的常见形态,而晶界的研究至关重要。在分子动力学中,用于建立多晶模型的软件主要有两款:atomeye和PolyMaker。由于个人之前使用atomeye的经验不佳,因此选择不使用该软件,以下是关于PolyMaker的安装和使用方法,直接进入正题:
1. PolyMaker官网
PolyMaker是一款用C++语言编写的多线程工具,用于为分子动力学制作输入文件。它能够建立一个具有指定密度的单原子样品,并考虑了周期性边界条件(PBC)。目前,该软件支持面心立方(FCC)、体心立方(BCC)和密排六方(HCP)等简单晶体类型的构建。PolyMaker支持多种输入文件格式,包括DL_POLY、LAMMPS和XYZ文件格式,能够方便地生成固定晶界结构的样品,满足不同原子数的晶粒需求。
以上内容为官网的简要翻译。(毕竟,六级522分,能看懂就行(✿◡‿◡))
以下是一个包含20个晶粒的样例:
2. PolyMaker下载及安装
在官网主页最左侧,点击“Download”按钮,可以看到许多说明。请确保完成以下操作并设置好环境:
然后,下载软件并解压,执行以下语句:
得到一系列解压文件:
接下来,执行以下语句:
具体过程如下:
编译后生成的文件(重要文件poly!!!重要文件poly!!!重要文件poly!!!):
3. PolyMaker命令及使用
以下是教学手册中的命令内容:
PolyMaker指令示例:
该命令用于生成一个面心立方原子结构,大小为100*100*100A,包含100000个原子,并以LAMMPS格式输出。
执行过程:
使用ovito软件进行in文件的可视化:
结语
本次制作耗时2小时,效率较高,图文并茂,内容质量高。
如有其他补充,请随时添加。