mRNA差别显示技术操作步骤
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发布时间:2024-10-07 18:10
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热心网友
时间:2024-11-25 12:12
操作mRNA差别显示技术的步骤如下:
首先,从样本中提取总RNA,参照Northern杂交方法(1)。
接着,进行第一链合成:取2μg总RNA,加入1μl cDNA合成引物,补足至5μl,分别标记为1A、2A、PC A等。PC作为阳性对照。混合均匀后离心,然后在70℃孵育3分钟,再在冰浴中冷却2分钟。
接着,准备dNTP混合液,每5μl反应液中包含5×第一链缓冲液、dNTPs、MMLV逆转录酶等,按照指定比例加入。在42℃条件下进行1小时的逆转录反应,然后在75℃下终止反应,冷却后置于冰上离心。
将反应液转移至新管中,用ddH2O稀释cDNA,将样本和对照分别转到1B、2B等新管中,保存在-20℃备用。
进行dd-PCR时,以P1和T9为例,设置不同的反应体系,包括实验组和对照组。在PCR管中加入cDNA样本、引物以及预配的PCR试剂混合液,执行PCR扩增,循环参数设定在GeneAmp PCR Systems 2400 & 9600上。
扩增结束后,进行电泳和放射自显影,使用6%变性聚丙烯酰胺凝胶进行分离。取样后进行差异条带回收,利用原引物进行再扩增,通过电泳确认产物,进一步进行Northern杂交验证基因的存在。PCR产物还需进行TA克隆、DNA序列测定和检索分析,以获得完整的基因信息。