BLAST中的E值(E-value)

发布网友发布时间：2024-10-07 18:05

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热心网友时间：2024-10-07 21:11

BLAST是一种用于生物信息学中蛋白质或核酸序列比对的算法，其结果中包含两个关键值：S值与E值。S值反映两序列间的同源性，数值越高表示相似程度越大。E值则是评价S值可靠性的指标，它表示在随机情况下，其他序列与目标序列的相似度超过S值的概率。因此，E值越低，S值的结果越可信。

E值的计算公式为 E=K*m*n*(e-lambda*S)。其中，K和lambda与数据库和算法有关，被视为常数；m代表目标序列的长度，n代表数据库的大小，S即上述提到的S值。通常，将E值设为小于10^-5被视为可接受的S值结果。具体而言，假设在相同的数据库下，当E值为0.001时，理论上会有1000条序列可能与目标序列的相似度超过当前S值。而将E值设置为10^-6时，可能仅得到一条最可靠的S值结果。