统计遗传学:第九章,GWAS+群体分析+亲缘关系分析
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发布时间：2024-10-05 12:01
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热心网友
时间：2024-12-01 00:55
在本章节中，我们将通过实际操作演示GWAS（全基因组关联研究）、群体结构分析以及亲缘关系分析的核心内容。我已修复了一些代码中的错误，并且这些内容将在后续的博文中详细讲解。以下是章节要点的概述：
使用PLINK进行GWAS分析，包括LD筛选和IBS矩阵计算
PCA（主成分分析）以识别不同祖先群体的遗传差异
GCTA软件用于遗传力估计和GWAS分析，包括关联性矩阵的计算
为了深入学习，强烈推荐加入飞哥的知识星球，那是一个专注于生物统计、数量遗传学和GWAS的社区，可以提问、获取学习计划，甚至参与实战项目。点击链接了解详情：[链接地址]
章节详细内容包括：
介绍关联分析，如何检查SNP与性状的关系，并通过LD剪枝排除冗余SNP
演示如何在PCA中处理遗传数据，识别主成分，以及它在控制人口分层中的应用
使用GCTA进行遗传力计算，了解V(G)和V(e)在表型变异中的贡献
章节提供的数据和代码示例，可以帮助你亲手实践这些技术。无论是PLINK的基本命令还是GCTA的高级应用，都能让你在实践中增长知识。
对于后续章节，我们将继续深入遗传学分析的实践，包括多基因评分的创建和更复杂模型的应用。快来一起探索遗传学的奥秘吧！
