一代二代三代测序的基本原理及区别是啥啊?
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发布时间:2024-10-09 22:43
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时间:2024-11-18 21:30
一代测序技术,即Sanger测序,通过利用双脱氧核苷酸终止PCR的原理,可快速确定序列中每个碱基的位置BP信息。此技术适用于单序列测序,能检测长度在1000bp左右的序列,广泛应用于单序列测序领域。
二代测序技术,也被称为高通量测序,解决了只能测一条序列的限制。通过物理或化学方式将DNA随机打断成小片段,进行建库,之后将库放入测序仪,一次检测大量DNA序列信息。通过生物信息学分析将小片段拼接成长片段,适用于大规模分析物种或样本中的所有序列信息。
二代测序的一大特点是能够同时检测大量序列,但序列长度受限于250-300bp。序列拼接依赖于重叠区域,部分序列可能多次被测序。由于建库过程中使用了PCR技术,可能导致量少的序列无法大量扩增,造成信息丢失。此外,PCR过程中可能引入错配碱基。
三代测序是对二代测序的升级,一次能测大量序列,测序长度可达10kb左右,且无需PCR富集序列,避免了信息丢失和碱基错配问题。然而,三代测序技术依赖DNA聚合酶活性,成本高,错误率在15%-40%,高于二代测序。错误率随机发生,通过增加测序覆盖度可纠错,但增加了测序成本。