位点特异性重组的整合酶和IHF
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发布时间:2022-05-09 05:32
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时间:2024-01-28 16:39
在att上都有特定的结合位点,体外实验也证明这两种蛋白质结合在attDNA的特定位点上。每一次重组过程需要20-40个整合酶分子及约70个IHF分子。故可能这两种蛋白质不仅是作为酶(发挥催化作用),而且在每次重组中都要形成某种复合物结构。通过缺失实验,证明attP至少要约250bp长,太短将使其功能丧失,而attB则较短,包括核心(core)在内约23bp长即有功能。长250bp的整个attP可绕在整合酶分子的周围,类似核小体的结构,其中含有约8个整合酶的单体,每个的分子量约为40000。attB和attP中有相同的15bp的核心序列。整合酶与两个核心都相结合。如果两个核心中有一个的顺序有所改变,则重组的效率将大为降低。但是如果两个核心序列发生了相同的改变,则顺序交换仍能进行。可见整合酶不但要求特异的序列,而且要求两个核心序列有同源性。
然而,如果λ前病毒受到诱导(inction),则整合作用将被逆转。此过程称为切出(excision)。切出后,细菌和噬菌体DNA恢复至原来完整状态。前病毒受到诱导时即产生又一种蛋白质,称为切出酶(excisionase)。切出酶和整合酶一起催化前病毒DNA两端的杂种att位点之间的重组。这时,整合酶和切出酶一同紧密结合在细菌前病毒杂种att位点上,显然这样就能促使反应向反方向进行。
位点特异性重组整合酶和IHF
attDNA上存在着特定的结合位点,体外研究已证实,位点特异性重组整合酶与IHF蛋白会精确地结合到这些位点上。每次重组过程的进行,需要大约20到40个整合酶分子和70个IHF分子的协同作用。这表明,这两种蛋白质不仅作为酶起催化作用,还在重组过程中扮演着复合物构建者的角色。通过缺失实验,发现attP至少需要约2...
外泌体组分中的miRNA在病变细胞中的应用有哪些?
作为上海宇玫博生物科技有限公司的工作人员,我认为外泌体组分中的miRNA在病变细胞中的应用主要包括以下方面:1. 疾病诊断:某些特定的miRNA表达水平可以反映病变细胞的状态,因此可以用于疾病的早期诊断和分类。2. 药物研发:miRNA可以调节病变细胞的生物学行为,因此可以作为药物研发的靶点,开发出针对特定病变细胞的药物。3. 疾病预后预测:某些miRNA的表达水平可以预测病变细胞的病情发展和预后情况。4. 疾病治疗:通过调节miRNA的表达水平,可以干预病变细胞的生物学行为,从而达到治疗疾病的目的。外泌体中的miRNA在病变细胞中的应用:miRNA是一类内源性具有调控功能的非编码RNA,可以与靶mRNA的3’非翻译区结合,从而导致靶基因不同程度的差异性表达。当miRNA运送到远端细胞时外泌体可以保持miRNA的完成性。此外,外泌体中miRNA的分泌常用于...
位点特异性重组的整合
用四种成份混合起来组成反应系统:纯的整合酶;来自E.coli的一种辅助蛋白,称为整合作用宿主因子(IHF,integration host factor);镁离子;和含有噬菌体和细菌DNA发生重组交叉的特异位点(称为attP和attB,att源自attachment)的DNA片段。对于这个DNA片段,一个简单的制备方法就是人工构建含attP和attB两者质...
位点特异性重组的整合和切出
因此,重组位点的识别就决定了位点专一性重组的方向──整合或切出。虽然位点专一重组是可逆的,但反应的方向取决于不同环境条件,这对决定噬菌体的生命力周期是非常性重要的。整合酶和IHF对整合和切出都是是必需的,而切出酶在控制反应方向上起重要作用──它对切出是必须的,但能抑制整合。在切除的...
位点特异性重组λ噬菌体的整合(integration)
λ噬菌体含有一个关键的酶,即λ整合酶(integrase),它在噬菌体DNA与E.coli染色体的重组过程中起着决定性作用。这种整合过程发生在两个DNA分子的特异位点,通过位点特异性重组,将两个环状DNA融合成一个更大的环状结构。在噬菌体感染的初期,大量整合酶被生成,因此几乎所有的受感染细胞都会经历DNA整合...
位点特异性重组λ噬菌体的整合和切出过程
在这个过程中,噬菌体两侧产生了新的杂种att位点,左侧的attL由BOP'组成,右侧的attR由POB'构成。整合和切出过程的关键在于不同序列的识别:整合需要attP和attB的匹配,而切出则需要attL和attR的识别。因此,重组位点的特性决定了整合还是切出的方向,这直接影响了噬菌体的生命活动周期。整合酶和IHF在...
简述基因位点特异的重组和同源重组的主要差别。
【答案】:位点特异的重组是由整合酶催化,在两个DNA序列的特异位点间发生的整合。同源重组是发生在同源序列间的重组,又称为基本重组。位点特异的重组需要整合酶,发生在两个DNA序列的特异位点间;同源重组不需要特异DNA序列,而是依赖两分子之间序列的相同或相似性,但也需要特异酶催化。
基因重组的原理
位特异性重组涉及整合酶的参与,它在两个DNA序列的特定位置促使片段的连接,形成具有特定位点的重组。而同源重组,也称为基本重组,发生在具有相似序列的DNA片段之间,通过配对和交换遗传信息,实现基因的重组和重新排列。基因重组对于生物进化、遗传变异以及适应环境变化等方面都起着至关重要的作用。
同源重组同源重组基因转移法
同源重组,又称基因转移法,是一种精密的生物技术手段,用于将外源基因精准地插入到受体细胞的染色体特定位置。其原理在于,当有与导入基因相似的同源序列存在时,重组酶,如整合酶和解离酶/转化酶家族,会在特定的附着点(att)催化单或双交换,从而替换缺陷基因片段,实现基因修复。位点特异性重组依赖于...
基因重组有几种形式,各有什么特点。
基因重组包括位点特异性的重组和同源重组两种类型。有整合酶催化的在两个DNA序列特异位点间发生的整合,产生位点特异的重组。特异重组依赖特异的DNA序列,如λ噬菌体的整和酶可识别噬菌体DNA和宿主染色体的特异靶位点,并进行选择性整合;反转录病毒整合酶识别整合反转录病毒cDNA的长末端重复序列等。另外有...
基因重组类型有哪些?
基因重组类型分为自然重组、噬菌体。自然界不同物种或个体之间的基因转移和重组是经常发生的,它是基因变异和物种进化的基础。基因重组包括位点特异性的重组和同源重组两种类型。有整合酶催化的在两个DNA序列特异位点间发生的整合,产生位点特异的重组。噬菌体的基因重组和细菌不同,而和真核的重组十分相似...