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如何制作简单的化学分子的pdb文件
发布网友
发布时间:2022-05-11 03:06
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热心网友
时间:2024-02-08 10:39
生成pdb的话总结下比较方便简单的有三种:1.Chemoffice,2.Gaussview,3.Materials Studio。生成的pdb文件gromacs都是可以识别的,但是个别的文件需要简单的处理一下,例如Materials Studio生成的文件中会多出几行乱七八糟的东西,你直接删掉就可以了,只保留原子的那些~
没太明白你所说的“键的连接和以前大不相同”,指的是键级变了吗?还是咋的?如果是键级变的话倒是没什么的,因为不同的软件中对于键的距离并不是按照统一的标准认的,稍微就行优化就可以了,或者说这合理的范围就行了~
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