fpkm能代表表达量吗
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发布时间：2022-05-19 09:01
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时间：2023-05-05 12:38
fpkm不能代表表达量。fpkm是衡量基因相对表达量一个公式。
FPKM是将Map到基因的Fragments数除以Map到Genome的所有Read数(以Million为单位)与RNA的长度(以KB为单位)。适用于单端和双端测序。
FPKM和RPKM的区别：
不同点就是FPKM计算的是片段（fragments），而RPKM计算的是数据（reads）。
Fragment比read的含义更广，因此FPKM包含的意义也更广，可以是pair-end的一个fragment，也可以是一个read。
FPKM和RPKM RPKM代表每千个碱基的转录每百万映射读取读数。 FPKM代表每千个碱基的转录每百万映射读取的碎片。
