只用血液标本进行基因测序是否能检测出体细胞突变?
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发布时间：2022-05-17 18:38
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时间：2023-11-02 04:46
通常，血液样本中存在游离的DNA和RNA，可以通过二代测序检测到一些突变，但检测不完全。突变可分成生殖突变（继承，亲代染色体突变遗传到子代）和体细胞突变（生长过程中发生改变）。可以检测到突变，但不能分辨出哪些突变。目前可以分析一些生物特征识别算法，但是它们通常需要将多个样本与公共数据库进行比较，并且准确性并不是很高。
目前，液体肿瘤活检中循环肿瘤DNA突变的检测是使用二代测序技术检测外周血中的体细胞肿瘤细胞突变。原理是肿瘤组织中会有数目巨大的细胞死亡，而死亡细胞的DN*段将进入血液。通过检测这些游离在外周血里的DNA，可以检测到源自肿瘤细胞的游离DNA中的基因突变。一般而言，还可以并行检测外周血中白细胞的遗传变异（生殖系变异）。两种结果的比较和分析可以区分体细胞突变和种系突变。
但是，这种检测也有局限性。例如，某些器官或组织（例如乳房）的凋亡细胞很难进入血液，因此这些器官或组织的体细胞变异更难于通过血液检测到。另一个例子是大量的ctDNA进入血液。需要较高的测序深度（例如10000X或更高）。同时，它需要消除背景噪声并添加UMI标签以消除在文库构建过程中引入的错误，以提高突变检测的灵敏度和特异性；如果没有针对外周血白细胞的对照测试，则由于血液的克隆性造血作用会导致大量假阳性突变（而克隆性的造血作用会随着年龄的增长而发生）。
检测体细胞突变的一种方式是比较组织样本和血液样本。血液样本可以用作正常样本。默认情况下，在血液中检测到生殖突变，并从血液中减去在组织样本中检测到的突变。从公共数据库和算法中的站点中减去检测到的突变，它们看起来更像是生殖突变，以获得体细胞突变。应该说，使用组织标本查找体细胞突变的可信度并不是很高。
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时间：2023-11-02 04:47
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时间：2023-11-02 04:47
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时间：2023-11-02 04:48
