为什么现在放线菌测序确定分类地位用16S rDNA
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发布时间：2022-04-24 10:31
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时间：2023-10-10 06:57
最佳答案16SrDAN是编码原核生物核糖体小亚基rRNA（16SrRNA）的基因。 长度约为1500pb，是细菌分类学研究中最常用、最有用的“分子钟”，其序列包含10个可变区（variable region）和与之相同的11个恒定区（constant region），可变区因细菌而异，且变异程度与细菌的系统发育密切相关[1-3]，Trand等通过对27株原核生物16SrDNA的比对发现其中至少在9个高度保守的寡聚体（oligomers）；较之23SrDNA等看家基因而异，它具有分子大小适中，突变率小等优点，素有“细菌化石”之称[2，4]。Woese等[3]与Olsen等[4]基于对16SrDNA的分析构建了现已被分认的全生命系统进化树，越来越多的细菌依据16SrDNA被正确分类或重分类，尤其是许多环境中的细菌[5。6]，如Funke等将棒杆菌依赖细胞毒性1组及类似棒杆菌重新确定为放线菌的一个新种，即钮氏放线菌中，Bennasar等通过比较14株施氏假单胞菌的7基因型（DNA-DNA杂交同源组），发现SP1402T（T为模式株）和SL401与施氏假单胞菌模式株明显不同，从而命名为一个新种称巴利阿里假单胞菌（Pseudomonas balearica）[2]；有的研究者还根据种内菌株间的RFLP而将各菌分为不同的核酸型（ribotype，RT）[7]。
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