基因命名是否与有机物命名一样?谢谢
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发布时间：2022-04-25 22:03
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时间：2022-06-17 23:04
(1)基因符号应为大写的拉丁字母或大写的拉丁字母和阿拉伯数字的组合。基因符号为了有使用的价值应尽可能地简洁, 而且不要试图它包含一个基因所有的已知信息。理想的符号应不超过6个字符。基因符号在书写时应用斜体或加下划线, 但在目录中例外。新的基因符号不能与已存在的基因符号重复。
(2)基因符号的第一个字符必须是字母, 随后的字符可以是字母或字母与数字的组合。
(3)基因符号在书写时应在同一行, 不允许在基因符号中使用上标或下标。
(4)不能使用罗马数字。在以前使用的基因符号中的罗马数字应改成相应的阿拉伯数字。
(5)不能使用希腊字母, 所有的希腊字符应改成相应的拉丁字母。
(6) 在以希腊字母打头的基因符号中须将它改成相应的拉丁字母并放在基因符号的后面。如GLA(galactosidase, alpha)、GLB(galatosidase, beta)。
(7)基因符号应简洁和特异, 并能传达基因的功能或特性。
基因符号的构建建议
1.等级符号, 基因家族和系列
(1)为了方便一批相关基因从计算机数据库中获取, 应尽量使用等级方式。
(2)当不同的基因编码具有类似功能的基因产物时, 基因位点的命名应紧跟在基因符号后加阿拉伯数字, 字母和数字之间不能使用空格, 如ADH1、ADH2、ADH3(三个乙醇脱氢酶基因位点)。但是, 如果它们已在历史上存在, 单个字母的后缀也可来命名这些基因位点, 如LDHA、LDHB、LDHC(三个乳酸脱氢酶位点)。
(3)基因符号的最后一个字符可用来指定基因的某一特性。在历史上曾用组织分布指定基因特性, 但如今更倾向于使用阿拉伯数字。因为以前认为的组织特异性在后来证实基因可能并不局限在这些组织中表达。
2.同源基因
(1)在不同脊椎动物中的同源基因应有相同的命名。
(2)如果一个基因先在其它物种中发现, 然后发现它在人中的同源基因, 则人的基因不应以H开头予以命名。
(3)为了区分来自不同物种的同源基因, 可在基因符号前加由人类细胞遗传学标准化委员会(Committee on Standardization in Human Cytogenetics)制定的三字母代码。但要注意的是, 这三字母代码仅用作出版, 而不作为基因符号的一部分。这个物种代码是加在基因符号前。如HAS代表人类(Homo sapiens), MMU代表家鼠(Mus musculus)。使用这些物种符号的基因符号的例子如(HSA)G6PD、(HSA)HBB、(MMU)A1b。
(4)如果与非脊椎动物或原核生物同源, 人类基因可用这些同源基因的名字, 并可在后面加L表示类似的(like)和加上数字编号(如果在人中有多个同源基因)。用H来表示同源的方法已不推荐, 将被停止使用。
3.酶和蛋白质 酶和蛋白质的命名应参照国际生物化学和分子生物*盟命名委员会(Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology)的推荐〔9〕。
4.一些具有特殊用途的保留字 一些字母或字母的组合放在基因符号的最后一个字母的后面表示特定的意义, 如P代表假基因(但要注意BP代表结合蛋白), L代表类似的, R代表受体或调节因子, N或NH代表抑制子。在其它场合应避免使用这些字母或字母的组合。
IUPAC有机物命名法
一般规则
取代基的顺序规则
当主链上有多种取代基时，由顺序规则决定名称中基团的先后顺序。一般的规则是：
取代基的第一个原子质量越大，顺序越高；
如果第一个原子相同，那么比较它们第一个原子上连接的原子的顺序；如有双键或三键，则视为连接了2或3个相同的原子。
以次序最高的官能团作为主要官能团，命名时放在最后。其他官能团，命名时顺序越低名称越靠前。
主链或主环系的选取
以含有主要官能团的最长碳链作为主链，靠近该官能团的一端标为1号碳。
如果化合物的核心是一个环（系），那么该环系看作母体；除苯环以外，各个环系按照自己的规则确定1号碳，但同时要保证取代基的位置号最小。
支链中与主链相连的一个碳原子标为1号碳。
数词
位置号用阿拉伯数字表示。
官能团的数目用汉字数字表示。
碳链上碳原子的数目，10以内用天干表示，10以外用汉字数字表示。
各类化合物的具体规则
烷烃
找出最长的碳链当主链，依碳数命名主链，前十个以天干(甲、乙、丙...)代表碳数，碳数多于十个时，以中文数字命名，如：十一烷。
从最近的取代基位置编号：1、2、3...(使取代基的位置数字越小越好)。以数字代表取代基的位置。数字与中文数字之间以 - 隔开。
有多个取代基时，以取代基数字最小且最长的碳链当主链，并依甲基、乙基、丙基的顺序列出所有取代基。
有两个以上的取代基相同时，在取代基前面加入中文数字：一、二、三...，如：二甲基，其位置以 , 隔开，一起列于取代基前面。
烯烃
命名方式与烷类类似，但以含有双键的最长键当作主链。
以最靠近双键的碳开始编号，分别标示取代基和双键的位置。
若分子中出现二次以上的双键，则以“二烯”或“三烯”命名。
烯类的异构体中常出现顺反异构体，故须注明“顺”或”反”。
炔烃
命名方式与烯类类似，但以含有叁键的最长键当作主链。
以最靠近叁键的碳开始编号，分别标示取代基和叁键的位置。
炔类没有环炔类和顺反异构物。
分子中既有双键又有三键时，名字以烯先炔后，分别标注位置号，碳数写在“烯”前面。
卤代烃·醚
卤代烃命名以相应烃作为母体，卤原子作为取代基。
如有碳链取代基，根据顺序规则碳链要写在卤原子的前面；如有多种卤原子，列出次序为氟、氯、溴、碘。
醚的命名以碳链较长的一端为母体，另一端和氧原子合起来作为取代基，称烃氧基。
醇
醇的命名，以含有醇羟基的最长碳链为主链；
由这条链上的碳数决定叫某醇，编号时让醇羟基的位置号尽量小；
其他基团按取代基处理。
主链上有多个醇羟基时，可以按羟基的数目分别称为二醇、三醇等。
醛
醛的命名，以含有醛基的最长的碳链为主链，其他部分作为取代基；
决定名称的碳数包括醛基的一个碳。
如果有多个醛基，则以含有2个醛基的最长碳链为主链，称二醛。
醛基作取代基时称甲酰基（或氧代）。
酮
以含有酮羰基最长的碳链为主链，按此链上的碳数（包括该羰基）称为“某酮”；并把羰基的位置号标在前面，尽量使位置号最小。
如果主链上有多个羰基，可称为二酮、三酮等。
羰基作取代基时称“氧代”。
羧酸
以含有羧基的最长碳链为主链，依照碳数（包括羧基）称为某酸。
主链上有2个羧基时，称为二酸。
羧酸酐
以形成酸酐的酸的名称称呼酸酐，再加“酐”字。
（如：CH3CO-O-CO-C2H5——乙酸丙酸酐）
若形成酸酐的两分子酸相同，直接称为“某酸酐”。
酯
以形成酯的酸和醇的名称命名，称为某酸某（醇）酯或某醇某酸酯。
若有多个醇或酸分子参与成酯，那么要在相应的醇或酸前面加上数目。
胺类
以与氮原子相连的最长碳链为主链，按照该链上的碳原子数称为“某胺”；
若是亚胺，氮原子上的较短烃基视作取代基，命名时称“N-某基”（N表示取代基连在氮上）
脂环烃类
单脂环烃
环烷烃的命名与烷烃类似，直接在烷类前面加“环”字即可。
环烯烃的命名与烯烃类似，编号由双键先设定为 1 , 2 号碳。
桥环烷烃
桥环烷烃中，多个环公用的碳原子称为桥头碳；
给碳原子编号，从一个桥头碳原子开始，依照环由大到小顺序编完所有的碳原子；
命名时，先称环的个数，然后在中括号里标明各个环上桥头碳之间的碳原子的个数，数字之间用点分隔，数字的个数总比环数多一个；
最后，按照环系上碳原子的个数，称为“某烷”。
如：
称为二环[3.2.0]庚烷。
螺环烷烃
螺环烷烃中，两个环公用的一个四级碳原子称为螺原子；
编号从小环开始，1号碳是紧挨螺原子的一个碳原子；
命名时，先称“螺”字，然后在中括号里标明各个环上非螺原子的个数，数字之间用点分隔；
最后，按照环系上碳原子的个数，称为“某烷”。
如：
称为螺[3.5]壬烷。
多环烯、炔烃
按照多环烷烃的规则命名，编号时尽量使重键的位置号最小，再把“烷”字换成“烯”或“炔”即可。
芳香族化合物
苯环系
苯的卤代物、烷基代物等，先称呼取代基的位置号和名称，再加“苯”字。甲基、乙基等简单烷基的“基”字可以省去。(如：1,2-二甲苯)
苯的烯、炔、醇、醛、酮、羧酸、磺酸、胺基代物等，以取代基的原形作为母体，先称“苯”（表示苯基），再称取代基的原形，编号时以取代基为主链，苯环为支链，与取代基相连的碳为1号碳。(如：苯乙烯)
芳烃的羟基代物称为酚，对于苯来说是苯酚。苯环上直接连有两个羟基时叫苯二酚。
其他环系
各种芳环系都有不同的名字，其取代物的命名方法和苯环类似。但这些环系一般都固定了编号的顺序（而不是像苯环一样只由取代基决定）：
萘环系
蒽环系
等等。
杂环化合物
把杂环看作碳环中碳原子被杂原子替换而形成的环，称为“某杂（环的名称）”；（如：氧杂环戊烷）
给杂原子编号，使杂原子的位置号尽量小。
其他官能团视为取代基。
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时间：2022-06-17 23:04
