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怎样从pdb数据库获取rna三级结构

发布网友 发布时间:2023-08-01 01:55

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热心网友 时间:2024-12-12 11:32

一个长度为n的RNA序列R=r1r2…rn 的假
  结结构定义为碱基配对集合S={(ri,rj )},其中
  (ri,rj)满足以下条件:
  (1)(ri,rj)∈{(A,U),(U,A),(G,C),
  (C,G),(G,U),(U,G)},1≤i
  3;
  (2)若(ri,rj)∈S,(rk,rg)∈S,则i =k当且
  仅当j =g;
  (3)愁(ri1,rj1),(ri2,rj2),…,(rip,rip)∈S,
  (rk1,rg1),(rk2,rg2),…,(rkq,rgq)∈S,且ri1 <ri2 <
  …<rip <rk1 <…<rkq,则有ri1 <ri2 <ri3 <…<rip
  <rk1 <rk2 <…<rkq <rjp <rjp-1 <…rj1 <rgq <rgq-1
  <…2或ri1 <ri2 <ri3 <…<rip <rj1 <
  rj2 <rj3 <…2
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