如何搜索PDB数据库?
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发布时间:2022-04-20 21:24
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时间:2023-10-03 11:21
http://www.uniprot.org/
新的“联合蛋白质数据库”预计在三年内建成,美国国家卫生研究所已决定为这项计划斥资1500万美元。这一全球性数据库有望在2003年年底初步在因特网上开放,各国研究人
员可通过访问其网址www.uniprot.org,免费获取信息。(新浪网 2002年11月01日)
蛋白质数据库(Protein Data Bank, PDB)是一个生物大分子,如蛋白质和核酸,的数据库。这些数据包括X光晶体衍射或者NMR核磁共振显示以及由全世界生物学家和生物化学家上传,在网上,它们可以通过PBD的会员组织(PDBe, PDBj, RCSB)免费获取。PDB是由一个叫做世界蛋白质数据库(Worldwide Protein Data Bank, wwPDB)管理。PDB是结构生物(如结构基因组学)的一个关键性资源。大部分学术刊物,以及一些官方科研机构[如美国的国立卫生研究院(NIH)],现在都要求科学家将它们研究的蛋白质、核酸结构上传到PDB
从PDB的网站上,可以通过蛋白质的编号查找到相应的3D结构,并可以将这个结构图下载到电脑中,通过PyMol、RasMol、Chimera、VMD、Swiss-PdbViewer等软件查看、编辑。 从PDB网站上下载的3D结构图的后缀名为.pdb。
参考资料:http://tech.sina.com.cn/o/2002-11-01/1814147513.shtml