PCR后测序结果怎样分析啊?请说得详细些,谢谢!
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发布时间:2022-05-02 07:39
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热心网友
时间:2023-10-11 22:39
首先,看测序峰图,如果结果的彩图显示峰型是尖锐单一的,碱基所对应的编码是一致的,那么可以判断序列是可以使用的。如果出现双峰,信号中断等异常现象,那么需要重新制备或者克隆后再测序。
其次,将PCR产物在NCBI上blast,看是否与你预期想要的片段符合,如果是匹配度一致,那么可以进行下一步,例如克隆,表达等。如果是匹配度不高,那么建议重新制备,最好是采用touchdown或巢式PCR等方法,提高产物的特异性后再扩增测序。
另外,如果是做SNP分析的,那么需要你通过看测序彩图,找出相应的突变杂合位点。