基因注释流程什么时候进行ncrna注释

发布网友发布时间：2022-05-02 01:47

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热心网友时间：2022-06-26 11:15

基因组注释分析主要包括哪些内容基因组注释包括以下方面的内容：（1）重复序列的预测。通过比对已知的重复序列数据库，找出序列中包含的重复序列，识别类型并转化为N或者X，统计各种类型重复序列的分布。（2）编码基因的预测。通过将转录组或EST数据比对到拼接后的基因组序列上，找出编码基因位置，预测编码基因结构。或者通过专业的外显子预测，预测编码基因的外显子结构。（3）小RNA基因的预测。通过比对已知的小RNA的数据库，或者通过生物信息(bioinformation)学预测，找出这些小RNA基因，并进行分类。（4）*序列和假基因的预测。基因功能的注释，使用的数据库包括NT/NR,SwissProt/TrEMbl,InterPro,KEGG,COG,Geneontology等，使用比对的方法，如blast，找出同源相近的基因，并注释功能。