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生物学里,motif 和 domain的区别是什么18

发布网友 发布时间:2023-10-27 09:50

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4个回答

热心网友 时间:2024-11-08 23:57

1、层级不同

Motif是位于二级和*结构之间的层次,Motif的层次接近二级结构。

Domain是位于二级和*结构之间的层次,Domain的层次接近*结构。

2、独立性不同:

domain是独立稳定的。

motif不是独立稳定的。


3、蛋白质结构不同:

Motif在生物学中是基于数据的数学统计模型,是特定的group的序列预测。对蛋白质来说,motifs可以被定义为蛋白质(蛋白质序列)属于一个给定的蛋白质家族。

domains是一种结构实体,通常代表蛋白质结构中独立折叠和行驶功能的一部分。因此蛋白质经常是这些结构域的不同的组合构建起来的。

4、组合形式不同:

motif通常是螺旋-环-螺旋,贝塔折叠的组合、阿而法螺旋组合等。

domain通常是球状压缩区或纤维状压缩区。

热心网友 时间:2024-11-08 23:58

最主要的区别是:

1、结构层级不同

Motif和Domain是位于二级结构和*结构之间的两个层次,Motif的层次接近二级结构,而Domain的层次接近*结构;domain是独立的稳定的,motif不是独立稳定的。两者也是完全不同的两个概念,但有时还有联系。

2、蛋白质结构中组合构建不同

Motif是蛋白中较小的保守序列片断,Domain通常为Motif的组合。

Motif:在生物学中是一个基于数据的数学统计模型,典型的是一段sequence也可以是一个结构,是特定的group的序列预测。对蛋白质来说,sequence motifs可以被定义为蛋白质(蛋白质序列)属于一个给定的蛋白质家族。

一个简单的motif可以是一个模式pattern,而这个模式被这个group中的所有成员共享。例如一个DNA sequence可以定义为转录因子结合位点,也就是序列倾向于被这种factor结合。


Protein domains:是一种结构实体,通常代表蛋白质结构中独立折叠和行驶功能的一部分。因此,蛋白质经常是这些结构域的不同的组合构建起来的。Domain是蛋白质结构(折叠)、功能和进化的单位。

例如WTRXEKXXY(这里,X代表任何氨基酸)。当然也有更复杂的motif模型。Motif有时和特定的功能联系一起。

扩展资料:

1、Motif:又称模体或基序,分为序列模体(sequence motif)与结构模体(structural motif),结构模体指蛋白质中相邻的二级结构单位组合在一起,形成有规则的在空间上能辨认的二级结构组合体。

结构模体在结构层次上高于二级结构,相当于超二级结构。

(1)至少2层二级结构,以疏水R侧链通过疏水相互作用稳定(内侧),亲水R侧链在外表面;

(2)β-链倾向于右手扭曲(见β-折叠,如β-桶);

(3)β链不能与相邻α-螺旋形成稳定氢键连接

(4)常见αα、βαβ、βββ、β曲折等。

2、Domain:又称基元、结构域,指多肽链在二级结构或motif的基础上形成*结构的局部折叠区,它是相对独立的紧密球状实体,一般由40-400氨基酸组成,是*结构的构件。常见有全α、全β、α/β、α+β等类型。

结构的独立性

(1)结构域是球状蛋白的折叠单位(可独立折叠),空间上相对独立;

(2)较小的蛋白质的*结构=结构域(单结构域);

(3)结构域之间形成铰链区(柔性),可相对移动。

参考资料:百度百科-Motif

热心网友 时间:2024-11-08 23:58

模体(motif)即超二级结构,简言之,就是二级结构有规律的组合。例如螺旋-环-螺旋,贝塔折叠的组合、阿而法螺旋组合等。再比如亮氨酸拉链、锌指结构都是典型的模体,它们执行一定的功能,即模体即是结构的单位,又是功能单位,他们可直接作为结构域和*结构的建筑块。某些蛋白质因子与DNA大沟结合的 部位靠的就是某些特异的模体。
结构域(domain)是指在较大的蛋白质分子中形成的某些在空间上可以辨别的结构,往往是球状压缩区或纤维状压缩区。它们也既是结构单位,又是功能单位。例如免疫球蛋白的功能区就是结构域。

这两个是生物化学里的不同的概念

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热心网友 时间:2024-11-08 23:59

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