NCBI保守结构域怎么分析

使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。具体可以进入NCBI后选择Conserved Domain然后点击Search。搜索结果中有四种类型的匹配：特定匹配（specific hits），非特定匹配(non-specific hits)，这些匹配所属的超家族(superfamily)，以及多结构域(multi-domains)。

结构域，作为蛋白质中的功能模块，是进化过程中保持相对稳定的区域。通过CD-Search对序列进行分析，研究者可以获取关于结构域的详细信息，如名称、位置，以及与其他蛋白质的相似性，这对于解读蛋白质的功能至关重要。CD-Search的核心功能包括利用Conserved Domain Database (CDD) 进行结构域识别，提供详尽的...

保守结构域是指在生物进化或者一个蛋白家族中具有不变或相同的结构域,他们一般具有重要的功能,不能被改变。 本回答由网友推荐 举报| 答案纠错 | 评论 7 0 EDIwizard 采纳率:42% 擅长: 数学 物理学 化学 生物学 为您推荐: 结构域名词解释 保守的结构域 保守结构域预测 基因保守结构域 保守域和结构域...

不同的软件对蛋白保守结构域的预测都是不同的，因为不同网站里的数据库与数据计算方式都可能不一样，结果也就会有差异。个人通常选择NCBI预测，但是如果是研究蛋白结构方面的内容，建议多选择几种蛋白预测网站试试。

首先在NCBI上对两个蛋白的核苷酸序列进行比对,看其相似性有多高;接下来在对二者的氨基酸序列进行比对(NCBI 上即可),分析二者的保守结构域是否一致;最后再搜集对于二者已发表的文献,从直接实验数据中进行比较.

保守结构域的分析则借助NCBI的Batch CDD在线工具，通过输入P450基因家族蛋白序列进行在线分析，结果文件下载后在TBtools中进行可视化。基因结构分析则通过TBtools的Visualize Gene Structure插件完成，需要输入基因组注释的GFF文件和P450基因名，从而生成详细的基因结构图。最后，基因家族的进化分析通过MEGA构建进化树...

也可用NCBI的conserved domain description 查询看有没有相应的记录，如果是查这个的话，记录结果会更多。查询的范围要靠慢慢了解去选择的。如果有了某个结构域的结构数据，还可以用NCBI提供的VAST工具去做比对，看有没有相似的结构在数据库里存在，这类似序列比对工具BLAST。

这个NCBI没有相关的功能，这个是以核苷酸序列为主。因为等电点特性是蛋白质水平的分子特性，可以到swissprot进行查询，查询蛋白质等电点需要到专业的平台进行查询。另外NCBI开发有Genbank等公共数据库，提供Pubmed、BLAST、Entrez、OMIM、Taxonomy等工具，可对国际分子数据库和生物医学文献进行检索和分析。

转录因子结合位点不在编码区内，而在起始位点上游，所以知道蛋白质序列找转录因子结合位点没有关系。找蛋白质结构域可以用GenBank的Conserved Domain Database （CDD）http://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/

蛋白质数据库（HPDB）对每个蛋白质分子结构说明部分做了中文翻译（最新加入数据库的分子除外），内容包括分子结构定性描述、样品的来源、表达载体、宿主、化学分析方法、分子结构组成成分等。这些信息并同蛋白质分子结构数据存储于数据库，因此HPDB支持中文查询。蛋白质数据库（HPDB）虽然翻译了“分子结构说明...