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【星耀小课堂】mRNA篇|mRNA序列设计——如何进行密码子优化_百度...

发布网友 发布时间:2024-07-02 23:16

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热心网友 时间:2024-07-20 23:36

在探索异源蛋白高效表达的神秘领域,mRNA序列设计中的密码子优化是关键一环。星耀小课堂揭示,这个过程的目标是提升与宿主细胞的无缝对接,减少翻译过程中的阻碍和mRNA的自然降解。


一、密码子优化的魔力


通过提高与细胞的密码子匹配度,我们确保翻译的流畅进行,避免罕见密码子带来的问题。这就像一把调音叉,确保音符的和谐演奏。


二、基本原则与策略


首先,我们运用CAI(密码子适应指数)这个工具来评估每种密码子的适应性,同时兼顾稀有密码子的需求,平衡效率与准确性。


1. 提升表达效率: 当CAI低于0.80时,意味着需要精细调整,考虑密码子组合的效率,以免复杂结构阻碍翻译的起始。


2. 密码子与稳定性: GC含量过高可能影响基因表达,通过优化,我们设法保持在51%的理想区间,确保mRNA的稳定性和蛋白表达。


3. UTR与折叠: 5'端UTR的折叠与蛋白质的翻译起始息息相关,LinearDesign算法考虑了CAI和最小自由能(MFE),优化mRNA结构。


以SARS-CoV-2 Spike蛋白为例,优化不仅关注CAI,还兼顾MFE,以提升mRNA的稳定性和表达持续时间。


未来趋势与实践


传统算法的优化效果有限,而LinearDesign则更进一步。目前,我们依赖开源工具,但未来期待更智能的算法系统。耀海生物,作为专业的生物CDMO服务商,提供包括定制化mRNA合成在内的一站式科研级服务,如10,000 nt的高效交付,7天内满足客户需求。


耀海生物凭借十年的研发创新,致力于为全球制药企业提供全面的CDMO解决方案,助力新药研发,推动中国生物医药行业的进步。他们的服务不仅包括重组蛋白和mRNA的生产,而且在UTR优化、密码子设计和纯化工艺上精益求精,确保每一份样品都达到高质量标准。


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