资源|七大模式生物数据库
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发布时间:2024-05-29 16:17
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时间:2024-06-04 05:49
揭示生物研究的秘密武器:七大模式生物数据库
模式生物,作为揭示生命科学普遍规律的关键角色,凭借其繁殖迅速、操作便捷的特性,为科研人员提供了丰富的研究平台。其中,小鼠(MouseGenome Informatics)和黑腹果蝇(FlyBase)尤为瞩目,它们分别是遗传学研究的代表,各自承载着多项诺贝尔奖的辉煌。
1. 小鼠遗传宝库——MGI
作为遗传信息的宝库,MGI为小鼠研究者提供了详尽的遗传数据支持。它不仅是科研工具的集大成者,更在跨物种比较和在线数据分析中发挥着重要作用,为多领域研究拓宽了视野。
2. 蛋白质研究的桥梁——Xenbase
非洲爪蟾的 Xenbase数据库,专为胚胎学和基因组研究而生,其基因组、表达和功能信息,为理解生命早期发育提供了坚实的基石。
3. 脊椎动物模型新星——Zebrafish Information Network (ZFIN)
斑马鱼凭借其与人类基因的高度相似性,成为基因研究的热门选择。ZFIN数据库涵盖了基因、解剖学和研究进展,为深入探索生命奥秘提供了重要窗口。
4. 植物遗传学的典范——Arabidopsis Information Resource (TAIR)
拟南芥作为植物生物学模式生物,TAIR数据库集成了基因组、表达和种子库信息,为植物遗传研究提供了无可比拟的资源。
5. 单细胞真菌的遗传解析——Saccharomyces Genome Database (SGD)
酵母,作为单细胞真菌的代表,SGD数据库深入挖掘酿酒酵母的遗传学和分子生物学数据,揭示了生物功能的深层联系,对于遗传学研究具有重要意义。
生物研究的世界千变万化,这些模式生物数据库如同知识的灯塔,引导着科研者探索生命的秘密。它们不仅为实验提供了丰富的数据资源,还推动着生物学领域的突破性进展。
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中国有哪七大生物基因库
佳学基因的基因库有以下几个部分组成。基因实体库,用来贮存DNA样本。基因功能库,用来贮存具有特殊功能的DNA序列。罕见疾病DNA数据库。基因序列变化数据库。人类基因序列变化与人体表征数据库。
生物信息学数据库汇总
1.2 DNA序列数据库 包括与DNA的复制、转录、修复等有密切关系的蛋白质因子。1.3 RNA序列和核糖体数据库 1.4 蛋白质结构和分类数据库 第二类:按照物种来分 物种分类 2.1 人类基因组测序中心 2.2 原核生物基因组 2.3 原生生物和线虫基因组 2.4 真菌基因组 2.5 昆虫基因组 2.6 鱼类数据库...
生物数据库网站大全及其用途(收藏版)
核心数据库核酸数据库: NCBI的GenBank:美国国家生物技术信息中心的强大资源,提供DNA/RNA/蛋白质序列比对和注释。 ENA:欧洲核苷酸序列数据库,由EMBL维护,国际核酸序列数据库合作联盟的一部分。 DDBJ:日本DNA数据库,INSDC成员。 Ensembl genome browser: 人等脊椎动物基因组数据库。 Mic...
生物信息学的数据库有哪些类型各有何特点
生物信息学的数据库的类型有基因组数据库、蛋白质数据库、代谢组数据库、基因调控数据库、生物样本数据库,具体特点如下:1、基因组数据库:这些数据库存储了各种生物体的基因组序列信息,包括DNA序列、RNA序列和蛋白质序列等。这些数据库的特点是数据量大、复杂度高,需要使用专业的生物信息学工具进行分析...
生物数据库可以分为哪几大类
具体如下:1、一级核酸数据库:存储的是通过各种科学手段得到的最直接的基础数据。如测序获得的核酸序列等。2、二级核酸数据库:是通过对一级数据中数据的分析整理归纳注释构建的具有特殊生物学意义和专门用途的数据库。3、蛋白质数据库一级蛋白质数据库:存储的是通过各种科学手段得到的最直接的基础数据...
做科研必须收藏的实用生物数据库,都有什么呢?
生物志库收录近10万种中国现生生物物种,包括植物、动物、菌物等,数据权威、可靠,经科学出版社编辑队伍专业、严谨的编校过程,确保每条信息均有据可考,每幅图片均专业鉴定。志库还注重资源聚集,开设药用植物、栽培植物、濒危动植物、入侵生物等专题。志库提供全面的物种信息,包括中文名、拉丁名、俗名...
生物信息数据库分为哪四大类
按大小可以分为1.公共数据库 2. 从公共数据库中取数据做进一步处理的专业数据库,提供更多的分析工具 按功能分可以有 基因库GENEBANK,蛋白库UNIPROT, 结构库PDB, 功能分类 GO库,通路库 KEGG。不用专注于4这个数字。随着科研的进步还会有更多的数据库出来。
生物信息学数据库大全(归纳整理版)
主要类别综合数据库DNA序列数据库: 关注DNA复制、转录和修复过程中相关的蛋白质因子。RNA序列与核糖体数据库蛋白质结构和分类数据库按照物种分类人类基因组原核生物原生生物和线虫真菌昆虫鱼类啮齿动物(如小鼠)家畜和家禽农作物拟南芥基因组按照功能领域分类序列比对细胞器数据库基因表达数据库基因突变、病理与...
科研基础——鱼类(比如斑马鱼)疾病靶点数据库有哪些?
探索鱼类健康领域的科研基石,斑马鱼(Danio rerio)作为重要的模型生物,其疾病靶点数据库犹如科研地图中的关键坐标。让我们一起探索几个不可或缺的数据库资源:1、Ensembl基因组宝库Ensembl,隶属于EMBL-EBI,是全球领先的脊椎动物基因组浏览器,专为深入研究模式生物基因组而设计。它不仅注释了海量基因,还...