发布网友 发布时间:2024-05-29 17:03
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热心网友 时间:2024-05-30 01:20
肽平面及二面角名词解释如下:
绕Cα-N键轴旋转的二面角(C-N-Cα-C)称为φ,绕Cα-C键轴旋转的二面角(N-Cα-C-N)称为ψ,这样多肽链主链的各种可能构象都可用φ和ψ这两个二面角或扭角来描述。
ψ的最大允许区域为-71º-(-22º)或20º-(+180º)φ的最大允许区域为-180º-(-45º)
一个多肽的主链为-[C-N-C-C-N]-,自左向右分别为C1,N1,C2,C3,N2C1-N1-C2形成的平面与N1-C2-C3形成的平面之间因为N1-C2之间的化学键旋转而成一定的角度,叫做二面角φ.同理N1-C2-C3形成的平面与C2-C3-N2形成的平面之间的角度是二面角ψ
肽键具有一定程度的双键性质,位于同一平面,参与肽键的六个原子C、H、O、N、Cα1、Cα2不能自由转动,此平面就是肽平面,也叫酰胺平面。
肽平面里N原子是sp3不等性杂化,有三个成键电子,本来与氢原子成三角锥结构的。但结合成肽平面是由于空间效应,N上未成键的一对电子与C和O共轭。所以不能随意旋转,所以形成一平面。
肽平面的范围
一个肽平面绕N-Ca键旋转的角度用F表示,而绕Ca-C1键旋转的角度用Y表示,顺时针方向为正,反时针为负,理论上F和Y可以取-180°至+180°之间的任一个角度。
生物物理学家G.N.Ramachandran等人构建了一个空间填充的肽的模型,并通过计算来确定多肽链中F和Y立体上允许的值。用Y对F作图,得到一个二维的图,称之Ramachandran构象图。
肽键,肽单元,肽平面--氨基酸之间脱水以后形成的酰氨键-C‖O-N/H-叫肽键。由于肽键具有“半双键”的性质,使得肽键两端的集团不可能环绕肽键旋转,而处在一个平面上,该平面称为肽键平面。