分子生物学高手进,如何进行多物种的基因同源性比对,预测蛋白质等电点,跨膜区域,信号肽,二级结构预测?
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发布时间:2022-05-05 17:00
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热心网友
时间:2023-10-31 04:01
第一个问题你可以转换成FASTA格式,或者把所有的序列在NCBI中用BLAST两两对比。
蛋白类的我不懂,不便说。
PCR退火温度一般式设计软件Tm减去1-3度,根据实验调整
热心网友
时间:2023-10-31 04:02
假如你有了 这2段基因,那可以用DNAMAN 进行比对,很方便的。
热心网友
时间:2023-10-31 04:02
对比同源性一般不是用BLAST,而是用DNA alignment. 可以用软件MEGA。 有序列了做一个fasta还不容易吗?建一个txt文件,写入下面类似的东西:
>your gene name and other stuff
atttcccctgggg
这就是fasta格式。
“预测等电点,跨膜区域,信号肽,二级结构”,这么复杂的东西,不是在知道上问问就能找到答案的。多在google上搜索一下,记得是google,不是百度。搜索什么什么 prediction,应该有相应的软件或网站的。科研不是“急求”就能求到的,不懂的东西多半还是要靠自己搜,没有人知道得那么全面。
PCR退火温度需要比Tm低一些,但是Tm会根据条件不同而变化,所以还是自己试出来的。退火温度高一点,会提高特异性,但也可能P不出来,一切看你的目的。多试。