质粒DNA酶切不完全是什么现象
发布网友
发布时间:2022-05-03 11:31
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热心网友
时间:2022-06-19 12:53
质粒DNA酶切不完全,可能是你使用的试剂盒的原因也可能还有酶切的原因。
第一、抽的质粒溶在什么溶液里?如果TE中EDTA的浓度高,会影响酶切
第二、,酶切时有几个关键因素,比如酶切体系,DNA的量,酶切时间等,酶量有时过高也不好,里面的甘油会影响酶切反应。另外,你可以先切一到两个小时,再补加一点酶,这样效果比你一次加进很多酶都好。
你可以用自己配的试剂抽提看看,我们最近用自己配的试剂抽提质粒,效果很好,杂质很少,而且浓度还挺高,又经济实惠。
热心网友
时间:2022-06-19 12:54
楼主你好,我的回答是建立在双酶切的基础上的。
现象的话你通过跑一个琼脂糖凝胶电泳就能看出来,空载质粒完全切割的话应该只有一条带,没切开的话会有2-3条带,而且位置比较高。 如果是连入了目的片段的载体,那么完全切割只有两条带。未完全切割的话会有3-4条带左右。
产生原因很多:
1.可能是酶切的时间不够。
2.可能是你用双酶切的时候buffer的体系两种酶不能发挥最大功效。
3.可能是用的酶量过高导致甘油量高,一般加酶的总量不超过总体系的10%。
4.可能是两个酶切位点离的非常近。两个酶空间上冲突相互干扰。
5.可能是质粒纯化的时候里面残留的乙醇等有机物降低了酶的活性。
6.本身酶的切割效率不高,这个和生产酶的公司也有关系,你可以用一些效率比较高的酶,比如EcoRI,BamHI,SacI,BgI I等,有意识的用好一点公司的酶,比如fermentas,NEB等,国产的就算了。
这都是实验里面总结的经验,希望对你有帮助~
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质粒双酶切后怎么会这个样子
也就是显得比原来的更大.酶切的不彻底的话,原来的那几条带也可能存在wjswj(站内联系TA)酶切之前你看到的应该是超螺旋,所以显的比较小:)zbq-92(站内联系TA)超螺旋的跑的最快,其次是线性的DNA,最后跑的最慢的是带缺口(即开环)的.用碱裂解法提取质粒看不到线性的带,...
质粒酶切后为什么会出现几条带?
如果是双酶切,而且片段大小适中,可以看见酶切的片段和载体,还有未切开的质粒。能不能区分超螺旋质粒和开链质粒,和所用琼脂糖凝胶的浓度,电泳时间,DNA纯度有关。试着延长跑胶的时间,应当是有区别的。酶切之前就有几条带,可能是因为质粒样品中有杂带,来源于杂菌或者降解。
如果一个DNA 酶解液在电泳后发现DNA 未被切动, 你认为可能是什么...
很简单嘛,做个对照啊,找个载体质粒(质粒上存在你的限制性内切酶能切开的位点)在相同条件下做酶切,电泳,观察质粒是否跟预期切开的长度一致,如果长度一致说明内切酶没有问题,你的DNA有问题;如果电泳长度与理论预期长度不一致,就说明你的内切酶有问题,换一支酶(内切酶是会过期的,请注意保质期)...
质粒pcr结果很好,为什么酶切却做不出来
提质粒的时候它们因为很短,自然不会被蛋白质细胞器基因组dna沉淀带走,最后和阴性质粒一起再接受pcr,所以出了假阳性。这也是为什么菌落pcr的假阳性远远高于菌液pcr的原因,一般菌液pcr不容易遇到假阳性的,尤其做了蓝白筛选或者用了带有致死基因的克隆载体,不过送去测序之前都最好经过酶切确认。
质粒浓度过高,酶切会有问题吗
可能是酶切过程中DNA降解了,如果是双切下来的片段很淡,可以看看切了多大的一段,太小的话容易弥散,或者没切开。双酶切省事,但是每次效率都很低,还不如单切后回收,再切一次来的好,多费不了2个小时。质粒存在于许多细菌以及酵母菌等生物中,是细胞染色体外能够自主复制的很小的环状DNA分子。质...
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⑤模 板核酸变性不彻底。在酶和引物质量好时,不出现扩增带,极有可能是标本的消化处 理,模板核酸提取过程出了毛病,因而要配制有效而稳定的消化处理液,其程序亦应 固定不宜随意更改。酶失活:需更换新酶,或新旧两种酶同时使用,以分析是否因酶的活性丧失或不够而 导致假阴性。需注意的是有时忘...
各位高手,请教一下,我做质粒的单酶切、与目的片段连接、转化,老是没...
如果是这种情况,那么问题有可能是在酶切后回收这一步。回收后的DNA质量直接影响到之后的T4连接酶作用和细菌转化。包括酶切回收buffer没有洗脱干净,或者留有酒精(对连接酶来说是比较致命的一点),或者最后的溶解buffer的酸碱值有问题,都会影响到细菌接受质粒的。建议你重新换一个酶切回收试剂盒。并且...