蛋白真能结合到DNA上吗?

发布网友 发布时间：2023-06-07 14:08

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热心网友 时间：2024-11-02 03:37

同其他蛋白质一样，功能由结构决定，能够和DNA结合同样取决于蛋白质的结构。提到蛋白质跟DNA的结合我觉得不得不提的是Transcription-Activator Like effector。下面简称TAL effector或者TALE。这是一种蛋白质，由一种植物病原体分泌。在攻击植物细胞的时候进入植物细胞核启动某些利于感染的基因。但是最吸引人的地方在于这种蛋白质除去头尾以外，是由重复的结构构成的，这些重复的结构叫repeat。而每一个repeat由33 - 35（最常见为34）个氨基酸组成，含有两个alpha螺旋（a和b)。像这样。重点在于图中标出的12和13两个氨基酸，它们被称为repeat variable di-resials （RVD）正因为这两个氨基酸，每一个repeat对应地可以识别一种DNA碱基，并与之结合。在自然界中，比较高频率的对应关系分别是NI – A，NG – T，HD – C，NN - A/G。进一步研究之后又发现，12号其实不那么重要，决定性作用的是13号氨基酸。红色表示氧原子，蓝色表示氮原子。图中绿色线表示氢键，闪电表示排斥。用通俗一点的话来说，蛋白质能够和DNA结合，很大一部分归功于结构。两条alpha链就像支架一样支撑着RVD，使得它能够申进DNA的大沟（major groove）。只有这样，氢键才有可能如上面图中一样形成。不过有文献表明（从图中也可以看出），NI - A 和NG - T这两对组合是不形成氢键的，相互作用的主要是靠shape complementarity（两者互补的结构）产生的范德华力。

热心网友 时间：2024-11-02 03:38

细菌和其它原核生物一样,没有核膜,DNA集中在细胞质中的低电子密度区,称核区或核质体（nuclear body）.细菌一般具有1-4个核质体,多的可达20余个.核质体是环状的双链DNA分子,所含的遗传信息量可编码2000～3000种蛋白质,空间构建十分精简,没有内含子.由于没有核膜,因此DNA的复制、RNA的转录与蛋白的质合成可同时进行,而不像真核细胞那样些生化反应在时间和空间上是严格分隔开来的.。每个细菌细胞约含5000～50000个核糖体,部分附着在细胞膜内侧,大部分游离于细胞质中.细菌核糖体的沉降系数为70S,由大亚单位（50S）与小亚单位（30S）组成,大亚单位含有23SrRNA,5SrRNA与30多种蛋白质,小亚单位含有16SrRNA与20多种蛋白质.30S的小亚单位对四环素与链霉素很敏感,50S的大亚单位对红霉素与氯霉素很敏感。

热心网友 时间：2024-11-02 03:38

在一个蛋白中，只有特定的一个或几个结构域是与DNA有相互作用的，有相互作用的氨基酸残基认为是DNA结合位点。目前认为DNA结合位点中，氨基酸的原子与DNA原子之间的距离是小于4.5Å的。20种氨基酸可分为非极性氨基酸，极性带电氨基酸和极性不带电氨基酸，而DNA骨架是极性带负电的，因此在20种氨基酸中，精氨酸、组氨酸、和赖氨酸这些极性带正电氨基酸所在序列是被认为是能结合DNA的特征区域，这也是一个DNA结合的必要条件。DNA结合区域一定是多极性带正电的氨基酸区域。