发布网友 发布时间:2023-05-25 03:14
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热心网友 时间:2024-12-02 11:57
各种不同类型的重复顺序的差别表现在三个方面:①每种重复顺序在基因组中出现的频率;②组成每个重复单位的核苷酸数;③每种重复顺序的特定的核苷酸顺序。依照复性反应的C0t值,可以将重复顺序分为高度重复顺序和中等重复顺序。 中等重复顺序的C0t1/2值一般在10^-1~10^2之间,重复频率在10^2~10^5之间。大部分中等重复顺序与基因组中的独特顺序相间排列,散布在整个基因组中,重复单位的一般长度大约是300±200个核苷酸对。许多中等重复顺序在细胞核中有它的相应的转录产物。至少有一部分这样的顺序属于有功能的基因,例如编码五种组蛋白的基因、核糖体RNA(rRNA,RNA为核糖核酸的缩写)基因、和各种转运RNA(tRNA)基因,这些基因在基因组中的重复频率往往在100~1000之间甚至更多。它们在染色体上往往成串排列,形成基因簇。另一种特殊形式的重复顺序是倒置重复顺序,也称回文顺序。这是顺序相同而取向相反的重复顺序,C0t1/2值一般在10^-5~10^-4之间,变性后再复性时能在同一单链内形成“发夹”式构型。
彼此间能够复性的重复单位的核苷酸顺序往往并不完全相同,这样一组重复顺序形成一个重复家族。实际上在任何一种生物中重复顺序都以重复家族的形式存在。在每种生物中一般都有若干重复家族;在相近的物种中存在着类似的重复家族。例如在人的基因组中有一个Alu重复家族(根据它们都有共同的*酶Alu的切点而命名),每个成员的长度大约是300个核苷酸对。Alu家族散布在整个基因组中。现已经发现在灵长类以及其他哺乳动物中都有类似Alu的重复家族。在这方面的研究将为基因组的进化提供重要的线索。