怎样用mega构建贝叶斯进化树
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发布时间：2023-05-18 01:00
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热心网友
时间：2023-09-19 02:17
1.
参考序列选择有几个原则:a,不选非培养(unclutured)微生物为参比;b,所选参考序列要正确,里面无错误碱基; c,在保证同属的前提下,优先选择 16S rDNA 全长测序或全基因组测序的种;d,每个种属选择一个参考序列,如 果自己的序列中同一属的较多,可适当选择 两个参考序列。
2.
序列比对 将整理好的序列导入 clustalx1.83,如图 接着: 程序自动运行,得出结果,自动输出 .aln 和 .dnd 为后缀的两个文件。 序列比对也可以直接用 MEGA 来做。 打开程序 MEGA,如下图所示: MEGA3.1 只能打开 meg 格式的文件,但是它可以把其他格式的多序列比对文件转换过来, 用.aln 格式(Clustal 的 输出文件)转换.meg 文件。
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时间：2023-09-19 02:17
