发布网友 发布时间:2023-05-17 05:53
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热心网友 时间:2023-05-21 21:25
胰腺癌数据集
此处有一疑问,GSE21501是Agilent双色芯片,作者是怎么处理得到的表达矩阵,然后进行验证的?
作者根据差异表达的铁死亡相关基因,构建胰腺癌的预后模型,并用GSE21501和ICGC-PAAD进行外部验证,并求FRG signature与免疫浸润的相关性,最后用RT-PCR和HPA验证构建模型基因基因的表达。
作者根据TCGA+PAAD构建模型,并在GSE21501和ICGC中验证。
风险评分与Cibersort评分的相关性,与免疫检查点的关系,同时对高低风险组进行富集分析。
作者选取10对临床标本,进行外部验证,同时用HPA数据验证蛋白表达。
构建模型基因的分析可以展开:例如,
模型构建后也可以展开:
参考链接:
The construction and analysis of a ferroptosis-related gene prognostic signature for pancreatic cancer