发布网友 发布时间:2022-04-23 13:48
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热心网友 时间:2023-10-16 13:33
如何使用命令行方式提交MS的计算作业Castep:1.打开MS界面,建立相关模型,并且在Castep的Calculatiton对话框中设置相关参数;2.不要单击Run进行Castep计算工作,而要在Calculation对话框中选择Files->SaveFiles,此时会在ProjectExplorer中出现一个新的目录,其中包括了使用命令行运行Castep的输入文件;3.使用Windows的文件管理器进入该目录(相关Project名称.files\Documents下),能够看到所需要的输入文件。注意,由于castep计算所需的.cell文件是隐藏文件,因此需要在“工具|文件夹选项”中选择“显示隐藏文件”。将以下文件拷贝到SGIPrism的相关路径下,*.cell、*.param。此外,需要将计算所需的赝势文件拷贝到SGIPrism相关路径下。(在CASTEP|Calculation|Electronic的more下Potential中可以看到所使用的赝势文件,该文件的路径在Windows系统的\MSModeling3.2\Data\Resources\Quantum\Castep\Potentials中,请将所出现的赝势文件全部拷贝到SGIPrism机器上,否则会导致计算失败)4.使用帐号登陆到SGIPrism下,进入相关文件夹(文件夹中包括刚才所有的文件),并执行命令:>chmod777*.*>/home/msi/ms/CASTEP/bin/RunCASTEP.sh-npnseedname注:-np表示使用多CPU进行并行运算;n表示所使用的CPU数目seedname表示计算作业的名称,例如相关参数文件为Al.param,Seedname则为Al,不带后缀名5.计算完成后,请将该目录中所有的文件下载到本地机器上,并放到刚才在Visualizer下新建的目录中;6.在Visualizer的ProjectExplorer中单击右键,选择刷新,即可看到刚才所有计算得到的结果,并可在MS中进行分析。DMol31.打开MS界面,建立相关模型,并且在DMol的Calculatiton对话框中设置相关参数;#2.不要单击Run进行DMol计算工作,而要在Calculation对话框中选择Files->SaveFiles,此时会在ProjectExplorer中出现一个新的目录,其中包括了使用命令行运行DMol3的输入文件;3.使用Windows的文件管理器进入该目录(相关Project名称.files\Documents下),能够看到所需要的输入文件。注意,由于DMol3计算所需的.car和.mdf文件是隐藏文件,因此需要在“工具|文件夹选项”中选择“显示隐藏文件”。热心网友 时间:2023-10-16 13:33
如何使用命令行方式提交MS的计算作业Castep:1.打开MS界面,建立相关模型,并且在Castep的Calculatiton对话框中设置相关参数;2.不要单击Run进行Castep计算工作,而要在Calculation对话框中选择Files->SaveFiles,此时会在ProjectExplorer中出现一个新的目录,其中包括了使用命令行运行Castep的输入文件;3.使用Windows的文件管理器进入该目录(相关Project名称.files\Documents下),能够看到所需要的输入文件。注意,由于castep计算所需的.cell文件是隐藏文件,因此需要在“工具|文件夹选项”中选择“显示隐藏文件”。将以下文件拷贝到SGIPrism的相关路径下,*.cell、*.param。此外,需要将计算所需的赝势文件拷贝到SGIPrism相关路径下。(在CASTEP|Calculation|Electronic的more下Potential中可以看到所使用的赝势文件,该文件的路径在Windows系统的\MSModeling3.2\Data\Resources\Quantum\Castep\Potentials中,请将所出现的赝势文件全部拷贝到SGIPrism机器上,否则会导致计算失败)4.使用帐号登陆到SGIPrism下,进入相关文件夹(文件夹中包括刚才所有的文件),并执行命令:>chmod777*.*>/home/msi/ms/CASTEP/bin/RunCASTEP.sh-npnseedname注:-np表示使用多CPU进行并行运算;n表示所使用的CPU数目seedname表示计算作业的名称,例如相关参数文件为Al.param,Seedname则为Al,不带后缀名5.计算完成后,请将该目录中所有的文件下载到本地机器上,并放到刚才在Visualizer下新建的目录中;6.在Visualizer的ProjectExplorer中单击右键,选择刷新,即可看到刚才所有计算得到的结果,并可在MS中进行分析。DMol31.打开MS界面,建立相关模型,并且在DMol的Calculatiton对话框中设置相关参数;#2.不要单击Run进行DMol计算工作,而要在Calculation对话框中选择Files->SaveFiles,此时会在ProjectExplorer中出现一个新的目录,其中包括了使用命令行运行DMol3的输入文件;3.使用Windows的文件管理器进入该目录(相关Project名称.files\Documents下),能够看到所需要的输入文件。注意,由于DMol3计算所需的.car和.mdf文件是隐藏文件,因此需要在“工具|文件夹选项”中选择“显示隐藏文件”。