如何在MAC M1芯片上安装R的Bioconductor包
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发布时间：2022-12-25 04:56
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热心网友
时间：2023-10-11 11:30
对于m1的电脑，当我们尝试用过 BiocManager::install() 进行安装时，部分包会出现提示错误。下面我以DESeq2包为例，尝试直接安装提示错误：
这里需要我们确认好三件事情：
1.正确的安装好gcc，终端输入gcc看看是否有改命令，如果没有通过命令 brew install gcc 安装；
2.正确的安装好gfortran，如果没有安装好通过命令 brew install gfortran 进行安装。
3.安装Xcode command line tools,终端输入 xcode-select --install
首先查看一下gcc的路径，用 brew list gcc 命令进行查看：
随后编辑Makevars文件， vi ~/.R/Makevars
注意：最后的FLIBS需要和你上面的路径对应！！VER=- 11 这个数字取决于你的gcc版本！！
将安装的gfortran的路径链到R目录：
sudo ln -s /opt/homebrew/bin/gfortran /opt/R/arm64/bin/
这个时候我们重新安装，最好在命令行用R安装，用rstudio有时候会出现莫名错误！！
就可以顺利安装了。
导致安装失败的原因有几个：
