求助晶体解析中的B类错误

发布网友 发布时间：2022-12-19 16:21

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热心网友 时间：2023-09-21 09:09

求助晶体解析中的B类错误

本人是新手刚开始接触结晶体，check之后经修改剩下以下三个B类错误，求高人指点！！
PLAT220_ALERT_2_B Large Non-Solvent C Ueq(max)/Ueq(min) ... 9.0 Ratio
PLAT222_ALERT_3_B Large Non-Solvent H Uiso(max)/Uiso(min) .. 9.6 Ratio
PLAT242_ALERT_2_B Check Low Ueq as Compared to Neighbors for C15

第一个的解决方法
SIMU 0.01 0.02 3.8 $C
第二个问题
建议把氢删除用理论加氢， 或者把热参数改成-1.20000
第三个问题
C15可能要做劈裂处理。

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tuer

谢谢哈，由于是菜鸟您的第三个办法“C15可能要做劈裂处理”具体怎么操作不会呀，但是用了您的前两个办法后最后一个B类错误不知道为什么也没了，就剩这一个了：PLAT220_ALERT_2_B Large Non-Solvent C Ueq(max)/Ueq(min) ... 6.6 Ratio请问要怎么解决啊？

理论上用了第一个命令之后就能解决这个问题了。 估计你有碳原子无序了。你去LST文件里面看一下有无碳原子劈裂的现象。
找到 Principal mean square atomic displacements U
下面就是原子列表。 有劈裂的就会在该原子后面写着：
may be split into  0.6258  0.2177  0.3140  and  0.6169  0.1924  0.3010

tuer

4楼: Originally posted by cluster8676 at 2012-07-16 01:18:31
理论上用了第一个命令之后就能解决这个问题了。 估计你有碳原子无序了。你去LST文件里面看一下有无碳原子劈裂的现象。
找到 Principal mean square atomic displacements U
下面就是原子列表。 有劈裂的就会在该原 ...

刚看看了没有劈裂啊，碳原子无序要怎么处理啊？

cluster8676

5楼: Originally posted by tuer at 2012-07-15 14:07:41
刚看看了没有劈裂啊，碳原子无序要怎么处理啊？...

无序的处理其实不难，但是靠这样也说不清楚。
FVAR  0.133620  0.782250
PART 1
Ru3    5   0.580850  0.408430  0.805911 21.000000  0.03
PART 2
Ru4    5   0.506974  0.375615  0.647275 -21.000000  0.03
PART 0
要用到上面的part命令。

cluster8676

5楼: Originally posted by tuer at 2012-07-15 14:07:41
刚看看了没有劈裂啊，碳原子无序要怎么处理啊？...

你是用的xp么？最好找出是那个C用问题。

tuer

7楼: Originally posted by cluster8676 at 2012-07-16 21:36:48
你是用的xp么？最好找出是那个C用问题。...

哦，我是用shelxt解的，从热振动看应该是C16有问题

tuer

6楼: Originally posted by cluster8676 at 2012-07-16 21:36:12
无序的处理其实不难，但是靠这样也说不清楚。
FVAR  0.133620  0.782250
PART 1
Ru3    5   0.580850  0.408430  0.805911 21.000000  0.03
PART 2
Ru4    5   0.506974  0.375615  0.647275 -21.000000  ...

额。。。这个具体的怎么用啊，直接复制到ins文件里就行吗？太麻烦你拉！！

cluster8676

我建议你先把C16 ISOR一下看看会不会解决问题。

tuer

10楼: Originally posted by cluster8676 at 2012-07-16 22:07:42
我建议你先把C16 ISOR一下看看会不会解决问题。

我已经用了这个命令了：ISOR 0.01 0.02 C16，是不是参数设的不对或是解决不了问题？？

cluster8676

你到xp里面输入 info $C就能看出来是哪个C原子有问题了。说不定是别的而不是C16.

tuer

12楼: Originally posted by cluster8676 at 2012-07-17 09:22:45
你到xp里面输入 info $C就能看出来是哪个C原子有问题了。说不定是别的而不是C16.

看了一下确实是C16有问题啊，它的Ueq比其他的大将近一个数量级呢，这样怎么办啊？

cluster8676

你试试 用EADP命令
在ins文件里面加入 EADP C15 C16 C17 多加几个也无所谓

tuer

14楼: Originally posted by cluster8676 at 2012-07-17 11:32:11
你试试 用EADP命令
在ins文件里面加入 EADP C15 C16 C17 多加几个也无所谓

:cry::cry:我加了EADPC15 C16后问题倒是解决了但又出现了两个新的错误：PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for O8 -- C15 .. 12.3 su
PLAT413_ALERT_2_B Short Inter XH3 .. XHn H9 .. H16A .. 2.06 Ang.这可怎么办啊？PS:O8 C15 C16是乙醇的结构