数据挖掘0311
发布网友
发布时间：2023-01-04 17:38
共1个回答
热心网友
时间：2023-10-13 21:45
上调基因和下调基因是针对处理组而言。
下调基因-处理组比对照组表达量低的基因
散点图——强调个体之间的关系
箱线图——强化组与组之间的关系
箱线图越短说明数据越集中
越长说明数据越离散
箱线图和点图适用于差异基因少的情况下使用。
logFC是以2为底数，
logFC一般取1，1.2，1.5，1.75
左上图：组间差别大于组内差别。（为什么？）
左下图：
右侧图：组间差别小于组内差别
生信技能树公众号上“一文看懂主成分分析”
还是有点懵~~~~~~~
探针是一组短的核苷酸序列，能与目的基因的一段序列杂交。
表达矩阵的行名就是探针ID
列名是样本编号
差异分析的可视化就是火山图和热图
