SGE 集群相关命令
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发布时间：2022-12-28 23:17
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时间：2023-10-24 15:50
qstat -u user 查看某个用户作业
qstat -u * 查看所有用户索嘢
qstat -j jobID 查看某个作业详细信息
qstat -f 查看自己在每个节点作业信息
qhost 查看所有节点的使用信息
qhost -j按照节点显示任务
qhost -F展示每个节点的资源
qdel jobID 删除某个作业
qdel -u usrname 删除某个用户的所有任务
qhold job_id 挂起某个作业
qhold -u * 挂起所有作业
echo "snakemake" | qsub -cwd -q res
qsub -cwd -l vf=10g,p=2 -S /bin/bash -q res samples_bwa_01001.sh 提交任务到res节点
-cwd 在当前工作目录
-l 资源申请 vf 内存 p 核心数 h 指定节点
-q 申请队列
-N 作业名
qlogin -q res 交互登录到res节点
snodes 查看节点负载
查看当前用户在当前节点提交的所有任务，任务的状态有4中情况：
1. http://bioinformatics.mdc-berlin.de/intro2UnixandSGE/sun_grid_engine_for_beginners/how_to_submit_a_job_using_qsub.html
